RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455127.6

MCRIP1-201, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MCRIP1, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-201ENST00000455127 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.22■■■■■ 5.15
MCRIP1-201ENST00000455127 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.87■■■■■ 4.29
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCC9O60706 1549 aa40.77■■■■■ 4.12
MCRIP1-201ENST00000455127 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.43■■■■□ 3.9
MCRIP1-201ENST00000455127 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
MCRIP1-201ENST00000455127 NACADO15069 1562 aa39.32■■■■□ 3.88
MCRIP1-201ENST00000455127 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
MCRIP1-201ENST00000455127 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.14■■■■□ 3.86
MCRIP1-201ENST00000455127 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-201ENST00000455127 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.46■■■■□ 3.75
MCRIP1-201ENST00000455127 SCRIBQ14160 1630 aa38.24■■■■□ 3.71
MCRIP1-201ENST00000455127 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.17■■■■□ 3.72e-6■■□□□ 13.8
MCRIP1-201ENST00000455127 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.12■■■■□ 3.69
MCRIP1-201ENST00000455127 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.7■■■■□ 3.63
MCRIP1-201ENST00000455127 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.25■■■■□ 3.55
MCRIP1-201ENST00000455127 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
MCRIP1-201ENST00000455127 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.9■■■■□ 3.5
MCRIP1-201ENST00000455127 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
MCRIP1-201ENST00000455127 SMARCA4P51532 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
MCRIP1-201ENST00000455127 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
MCRIP1-201ENST00000455127 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.4■■■■□ 3.42
MCRIP1-201ENST00000455127 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.33■■■■□ 3.41
MCRIP1-201ENST00000455127 SMARCA2P51531 1590 aa36.31■■■■□ 3.4
MCRIP1-201ENST00000455127 NCAPD3P42695 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
MCRIP1-201ENST00000455127 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.22■■■■□ 3.39
MCRIP1-201ENST00000455127 HMGXB3Q12766 1538 aa36.11■■■■□ 3.37
MCRIP1-201ENST00000455127 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 WIZO95785 1651 aa36.03■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
MCRIP1-201ENST00000455127 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
MCRIP1-201ENST00000455127 NESP48681 1621 aa35.35■■■■□ 3.25
MCRIP1-201ENST00000455127 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.29■■■■□ 3.24
MCRIP1-201ENST00000455127 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.25■■■■□ 3.23
MCRIP1-201ENST00000455127 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.24■■■■□ 3.23
MCRIP1-201ENST00000455127 ERCC6Q03468 1493 aa35.13■■■■□ 3.21
MCRIP1-201ENST00000455127 CFTRP13569 1480 aa35.08■■■■□ 3.21
MCRIP1-201ENST00000455127 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
MCRIP1-201ENST00000455127 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.96■■■■□ 3.19
MCRIP1-201ENST00000455127 PRDM2Q13029 1718 aa34.85■■■■□ 3.17
MCRIP1-201ENST00000455127 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.84■■■■□ 3.17
MCRIP1-201ENST00000455127 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.77■■■■□ 3.16
MCRIP1-201ENST00000455127 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
MCRIP1-201ENST00000455127 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.67■■■■□ 3.14
MCRIP1-201ENST00000455127 CUX2O14529 1486 aa34.65■■■■□ 3.14
MCRIP1-201ENST00000455127 WDR62O43379 1518 aa34.55■■■■□ 3.12
MCRIP1-201ENST00000455127 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCC8Q09428 1581 aa34.32■■■■□ 3.09
MCRIP1-201ENST00000455127 TOPBP1Q92547 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
MCRIP1-201ENST00000455127 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.28■■■■□ 3.08
MCRIP1-201ENST00000455127 CUX1P39880 1505 aa34.13■■■■□ 3.05
MCRIP1-201ENST00000455127 IFT140Q96RY7 1462 aa34.03■■■■□ 3.04
MCRIP1-201ENST00000455127 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
MCRIP1-201ENST00000455127 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
MCRIP1-201ENST00000455127 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.98■■■■□ 3.03
MCRIP1-201ENST00000455127 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 SOGA1O94964 1423 aa33.91■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 TOP2BQ02880 1626 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 SYNJ1O43426 1573 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.89■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
MCRIP1-201ENST00000455127 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
MCRIP1-201ENST00000455127 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.993e-6■■■□□ 17.5
MCRIP1-201ENST00000455127 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 WDR97A6NE52 1622 aa33.68■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.66■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.51■■■□□ 2.96
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.5■■■□□ 2.95
MCRIP1-201ENST00000455127 GRIN2BQ13224 1484 aa33.47■■■□□ 2.95
MCRIP1-201ENST00000455127 PBRM1Q86U86 1689 aa33.44■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.39■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 TRIM41Q8WV44 630 aa33.39■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.37■■■□□ 2.93
MCRIP1-201ENST00000455127 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
MCRIP1-201ENST00000455127 OSCARQ8IYS5 282 aa33.31■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 FBLN2P98095 1184 aa33.3■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 CHD1O14646 1710 aa33.3■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 KIF27Q86VH2 1401 aa33.28■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.26■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 SYNJ2O15056 1496 aa33.23■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 ADAMTS12P58397 1594 aa33.16■■■□□ 2.9
MCRIP1-201ENST00000455127 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.13■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.13■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 IGF1RP08069 1367 aa33.12■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.06■■■□□ 2.88
MCRIP1-201ENST00000455127 GRIN2AQ12879 1464 aa33.04■■■□□ 2.88
MCRIP1-201ENST00000455127 CUL7Q14999 1698 aa33.01■■■□□ 2.87
MCRIP1-201ENST00000455127 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.93■■■□□ 2.86
MCRIP1-201ENST00000455127 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.9■■■□□ 2.86
MCRIP1-201ENST00000455127 NUP160Q12769 1436 aa32.87■■■□□ 2.85
MCRIP1-201ENST00000455127 CEP170Q5SW79 1584 aa32.87■■■□□ 2.85
MCRIP1-201ENST00000455127 EEA1Q15075 1411 aa32.77■■■□□ 2.84
MCRIP1-201ENST00000455127 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.75■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.74■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 ARHGEF11O15085 1522 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms