RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-215ENST00000586268 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
NEDD4L-215ENST00000586268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.22■■■□□ 2.75
NEDD4L-215ENST00000586268 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.81■■■□□ 2.68
NEDD4L-215ENST00000586268 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
NEDD4L-215ENST00000586268 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.29■■■□□ 2.12
NEDD4L-215ENST00000586268 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
NEDD4L-215ENST00000586268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCC9O60706 1549 aa26.78■■□□□ 1.88
NEDD4L-215ENST00000586268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD4L-215ENST00000586268 FOXD1Q16676 465 aa26.71■■□□□ 1.87
NEDD4L-215ENST00000586268 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD4L-215ENST00000586268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-215ENST00000586268 NACADO15069 1562 aa26.37■■□□□ 1.81
NEDD4L-215ENST00000586268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.18■■□□□ 1.78
NEDD4L-215ENST00000586268 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD4L-215ENST00000586268 SCRIBQ14160 1630 aa25.85■■□□□ 1.73
NEDD4L-215ENST00000586268 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.61■■□□□ 1.69
NEDD4L-215ENST00000586268 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.4■■□□□ 1.66
NEDD4L-215ENST00000586268 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.36■■□□□ 1.65
NEDD4L-215ENST00000586268 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
NEDD4L-215ENST00000586268 MSH5O43196 834 aa25.12■■□□□ 1.61
NEDD4L-215ENST00000586268 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD4L-215ENST00000586268 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD4L-215ENST00000586268 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NEDD4L-215ENST00000586268 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NEDD4L-215ENST00000586268 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD4L-215ENST00000586268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NEDD4L-215ENST00000586268 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.84■■□□□ 1.57
NEDD4L-215ENST00000586268 SMARCA4P51532 1647 aa24.83■■□□□ 1.56
NEDD4L-215ENST00000586268 ADRA2BP18089 450 aa24.8■■□□□ 1.56
NEDD4L-215ENST00000586268 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
NEDD4L-215ENST00000586268 POTEDQ86YR6 584 aa24.62■■□□□ 1.53
NEDD4L-215ENST00000586268 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NEDD4L-215ENST00000586268 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.59■■□□□ 1.53
NEDD4L-215ENST00000586268 SMARCA2P51531 1590 aa24.48■■□□□ 1.51
NEDD4L-215ENST00000586268 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.45■■□□□ 1.51
NEDD4L-215ENST00000586268 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NEDD4L-215ENST00000586268 NCAPD3P42695 1498 aa24.31■■□□□ 1.48
NEDD4L-215ENST00000586268 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NEDD4L-215ENST00000586268 HMGXB3Q12766 1538 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD4L-215ENST00000586268 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD4L-215ENST00000586268 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD4L-215ENST00000586268 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.74■■□□□ 1.39
NEDD4L-215ENST00000586268 CFTRP13569 1480 aa23.69■■□□□ 1.38
NEDD4L-215ENST00000586268 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.64■■□□□ 1.37
NEDD4L-215ENST00000586268 PRDM2Q13029 1718 aa23.63■■□□□ 1.37
NEDD4L-215ENST00000586268 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCC8Q09428 1581 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD4L-215ENST00000586268 NESP48681 1621 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD4L-215ENST00000586268 TRIM41Q8WV44 630 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD4L-215ENST00000586268 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
NEDD4L-215ENST00000586268 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD4L-215ENST00000586268 SYNJ1O43426 1573 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD4L-215ENST00000586268 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.33■■□□□ 1.32
NEDD4L-215ENST00000586268 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD4L-215ENST00000586268 TOP2BQ02880 1626 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD4L-215ENST00000586268 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD4L-215ENST00000586268 CUX1P39880 1505 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD4L-215ENST00000586268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.17■■□□□ 1.3
NEDD4L-215ENST00000586268 TOPBP1Q92547 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
NEDD4L-215ENST00000586268 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NEDD4L-215ENST00000586268 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
NEDD4L-215ENST00000586268 EEA1Q15075 1411 aa23.05■■□□□ 1.28
NEDD4L-215ENST00000586268 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD4L-215ENST00000586268 ERCC6Q03468 1493 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD4L-215ENST00000586268 SOGA1O94964 1423 aa23■■□□□ 1.27
NEDD4L-215ENST00000586268 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD4L-215ENST00000586268 WDR62O43379 1518 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD4L-215ENST00000586268 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD4L-215ENST00000586268 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NEDD4L-215ENST00000586268 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF27Q86VH2 1401 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 WDR97A6NE52 1622 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 CUX2O14529 1486 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-215ENST00000586268 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-215ENST00000586268 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-215ENST00000586268 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF21BO75037 1637 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD4L-215ENST00000586268 IFT140Q96RY7 1462 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD4L-215ENST00000586268 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD4L-215ENST00000586268 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD4L-215ENST00000586268 GOLGA3Q08378 1498 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD4L-215ENST00000586268 PRXQ9BXM0 1461 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD4L-215ENST00000586268 IGF1RP08069 1367 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD4L-215ENST00000586268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD4L-215ENST00000586268 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD4L-215ENST00000586268 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD4L-215ENST00000586268 CUL7Q14999 1698 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD4L-215ENST00000586268 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.58■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 PBRM1Q86U86 1689 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD4L-215ENST00000586268 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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