RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591997.2

WDR18-210, Transcript of WD repeat domain 18, humanhuman

TSL 3

Gene WDR18, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18-210ENST00000591997 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.36■■■■■ 5.65
WDR18-210ENST00000591997 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.21■■■■■ 4.83
WDR18-210ENST00000591997 ABCC9O60706 1549 aa45.06■■■■■ 4.8
WDR18-210ENST00000591997 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.97■■■■■ 4.47
WDR18-210ENST00000591997 NACADO15069 1562 aa42.68■■■■■ 4.42
WDR18-210ENST00000591997 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.5■■■■■ 4.39
WDR18-210ENST00000591997 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.1■■■■■ 4.33
WDR18-210ENST00000591997 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.05■■■■■ 4.32
WDR18-210ENST00000591997 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42■■■■■ 4.31
WDR18-210ENST00000591997 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
WDR18-210ENST00000591997 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
WDR18-210ENST00000591997 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.65■■■■■ 4.26
WDR18-210ENST00000591997 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.6■■■■■ 4.25
WDR18-210ENST00000591997 SCRIBQ14160 1630 aa41.21■■■■■ 4.19
WDR18-210ENST00000591997 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.15■■■■■ 4.18
WDR18-210ENST00000591997 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.71■■■■■ 4.11
WDR18-210ENST00000591997 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
WDR18-210ENST00000591997 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.58■■■■■ 4.09
WDR18-210ENST00000591997 NCAPD3P42695 1498 aa39.35■■■■□ 3.89
WDR18-210ENST00000591997 SMARCA4P51532 1647 aa39.3■■■■□ 3.88
WDR18-210ENST00000591997 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.26■■■■□ 3.88
WDR18-210ENST00000591997 SMARCA2P51531 1590 aa39.22■■■■□ 3.87
WDR18-210ENST00000591997 HMGXB3Q12766 1538 aa39.13■■■■□ 3.85
WDR18-210ENST00000591997 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
WDR18-210ENST00000591997 ERCC6Q03468 1493 aa38.95■■■■□ 3.83
WDR18-210ENST00000591997 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
WDR18-210ENST00000591997 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.88■■■■□ 3.81
WDR18-210ENST00000591997 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.8■■■■□ 3.8
WDR18-210ENST00000591997 CUX2O14529 1486 aa38.79■■■■□ 3.8
WDR18-210ENST00000591997 NESP48681 1621 aa38.72■■■■□ 3.79
WDR18-210ENST00000591997 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.58■■■■□ 3.77
WDR18-210ENST00000591997 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.51■■■■□ 3.76
WDR18-210ENST00000591997 WIZO95785 1651 aa38.37■■■■□ 3.73
WDR18-210ENST00000591997 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
WDR18-210ENST00000591997 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.29■■■■□ 3.72
WDR18-210ENST00000591997 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.27■■■■□ 3.72
WDR18-210ENST00000591997 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.18■■■■□ 3.7
WDR18-210ENST00000591997 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
WDR18-210ENST00000591997 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.94■■■■□ 3.66
WDR18-210ENST00000591997 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
WDR18-210ENST00000591997 WDR62O43379 1518 aa37.84■■■■□ 3.65
WDR18-210ENST00000591997 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
WDR18-210ENST00000591997 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.77■■■■□ 3.64
WDR18-210ENST00000591997 CFTRP13569 1480 aa37.77■■■■□ 3.64
WDR18-210ENST00000591997 PRDM2Q13029 1718 aa37.5■■■■□ 3.59
WDR18-210ENST00000591997 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
WDR18-210ENST00000591997 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.43■■■■□ 3.58
WDR18-210ENST00000591997 TOPBP1Q92547 1522 aa37.06■■■■□ 3.52
WDR18-210ENST00000591997 IFT140Q96RY7 1462 aa37.05■■■■□ 3.52
WDR18-210ENST00000591997 OSCARQ8IYS5 282 aa37.02■■■■□ 3.52
WDR18-210ENST00000591997 ABCC8Q09428 1581 aa37.01■■■■□ 3.52
WDR18-210ENST00000591997 TRIM41Q8WV44 630 aa37.01■■■■□ 3.52
WDR18-210ENST00000591997 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.97■■■■□ 3.51
WDR18-210ENST00000591997 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
WDR18-210ENST00000591997 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
WDR18-210ENST00000591997 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
WDR18-210ENST00000591997 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
WDR18-210ENST00000591997 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.63■■■■□ 3.457e-7■■■■□ 24.5
WDR18-210ENST00000591997 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.56■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.56■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.56■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.54■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 CHD1O14646 1710 aa36.54■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 SOGA1O94964 1423 aa36.51■■■■□ 3.44
WDR18-210ENST00000591997 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.5■■■■□ 3.43
WDR18-210ENST00000591997 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
WDR18-210ENST00000591997 CUX1P39880 1505 aa36.46■■■■□ 3.43
WDR18-210ENST00000591997 ARHGEF11O15085 1522 aa36.44■■■■□ 3.42
WDR18-210ENST00000591997 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
WDR18-210ENST00000591997 FBLN2P98095 1184 aa36.42■■■■□ 3.42
WDR18-210ENST00000591997 WDR97A6NE52 1622 aa36.4■■■■□ 3.42
WDR18-210ENST00000591997 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.3■■■■□ 3.4
WDR18-210ENST00000591997 GRIN2BQ13224 1484 aa36.21■■■■□ 3.39
WDR18-210ENST00000591997 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
WDR18-210ENST00000591997 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.15■■■■□ 3.38
WDR18-210ENST00000591997 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
WDR18-210ENST00000591997 PBRM1Q86U86 1689 aa36.13■■■■□ 3.37
WDR18-210ENST00000591997 SYNJ1O43426 1573 aa36.1■■■■□ 3.37
WDR18-210ENST00000591997 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
WDR18-210ENST00000591997 SYNJ2O15056 1496 aa36.09■■■■□ 3.37
WDR18-210ENST00000591997 ARAP1Q96P48 1450 aa36.08■■■■□ 3.37
WDR18-210ENST00000591997 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.07■■■■□ 3.36
WDR18-210ENST00000591997 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.06■■■■□ 3.36
WDR18-210ENST00000591997 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.03■■■■□ 3.36
WDR18-210ENST00000591997 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
WDR18-210ENST00000591997 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.94■■■■□ 3.34
WDR18-210ENST00000591997 TOP2BQ02880 1626 aa35.94■■■■□ 3.34
WDR18-210ENST00000591997 ADAMTS12P58397 1594 aa35.76■■■■□ 3.32
WDR18-210ENST00000591997 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
WDR18-210ENST00000591997 GRIN2AQ12879 1464 aa35.75■■■■□ 3.31
WDR18-210ENST00000591997 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.64■■■■□ 3.3
WDR18-210ENST00000591997 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.64■■■■□ 3.3
WDR18-210ENST00000591997 CEP170Q5SW79 1584 aa35.61■■■■□ 3.29
WDR18-210ENST00000591997 NUP160Q12769 1436 aa35.59■■■■□ 3.29
WDR18-210ENST00000591997 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.5■■■■□ 3.27
WDR18-210ENST00000591997 SHROOM2Q13796 1616 aa35.45■■■■□ 3.27
WDR18-210ENST00000591997 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.27■■■■□ 3.24
WDR18-210ENST00000591997 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
WDR18-210ENST00000591997 KIF27Q86VH2 1401 aa35.24■■■■□ 3.23
WDR18-210ENST00000591997 JPH4Q96JJ6 628 aa35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms