RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597572.1

MYO9B-210, Transcript of myosin IXB, humanhuman

TSL 5

Gene MYO9B, Length 660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9B-210ENST00000597572 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.44■■■■■ 4.22
MYO9B-210ENST00000597572 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.85■■■■□ 3.49
MYO9B-210ENST00000597572 ABCC9O60706 1549 aa36.02■■■■□ 3.36
MYO9B-210ENST00000597572 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.65■■■■□ 3.14
MYO9B-210ENST00000597572 NACADO15069 1562 aa34.64■■■■□ 3.14
MYO9B-210ENST00000597572 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
MYO9B-210ENST00000597572 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.48■■■■□ 3.11
MYO9B-210ENST00000597572 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.45■■■■□ 3.11
MYO9B-210ENST00000597572 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.31■■■■□ 3.08
MYO9B-210ENST00000597572 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.97■■■■□ 3.03
MYO9B-210ENST00000597572 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.71■■■□□ 2.99
MYO9B-210ENST00000597572 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.65■■■□□ 2.98
MYO9B-210ENST00000597572 SCRIBQ14160 1630 aa33.55■■■□□ 2.96
MYO9B-210ENST00000597572 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.28■■■□□ 2.92
MYO9B-210ENST00000597572 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.2■■■□□ 2.91
MYO9B-210ENST00000597572 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
MYO9B-210ENST00000597572 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.62■■■□□ 2.81
MYO9B-210ENST00000597572 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.37■■■□□ 2.77
MYO9B-210ENST00000597572 SMARCA4P51532 1647 aa32.15■■■□□ 2.74
MYO9B-210ENST00000597572 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
MYO9B-210ENST00000597572 NCAPD3P42695 1498 aa31.99■■■□□ 2.71
MYO9B-210ENST00000597572 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.99■■■□□ 2.71
MYO9B-210ENST00000597572 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.94■■■□□ 2.7
MYO9B-210ENST00000597572 SMARCA2P51531 1590 aa31.91■■■□□ 2.7
MYO9B-210ENST00000597572 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.88■■■□□ 2.69
MYO9B-210ENST00000597572 HMGXB3Q12766 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
MYO9B-210ENST00000597572 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
MYO9B-210ENST00000597572 WIZO95785 1651 aa31.58■■■□□ 2.65
MYO9B-210ENST00000597572 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
MYO9B-210ENST00000597572 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
MYO9B-210ENST00000597572 NESP48681 1621 aa31.2■■■□□ 2.59
MYO9B-210ENST00000597572 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.12■■■□□ 2.57
MYO9B-210ENST00000597572 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.02■■■□□ 2.56
MYO9B-210ENST00000597572 ERCC6Q03468 1493 aa30.98■■■□□ 2.55
MYO9B-210ENST00000597572 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.88■■■□□ 2.53
MYO9B-210ENST00000597572 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.87■■■□□ 2.53
MYO9B-210ENST00000597572 CFTRP13569 1480 aa30.86■■■□□ 2.53
MYO9B-210ENST00000597572 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.84■■■□□ 2.53
MYO9B-210ENST00000597572 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
MYO9B-210ENST00000597572 CUX2O14529 1486 aa30.76■■■□□ 2.51
MYO9B-210ENST00000597572 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.64■■■□□ 2.5
MYO9B-210ENST00000597572 PRDM2Q13029 1718 aa30.62■■■□□ 2.49
MYO9B-210ENST00000597572 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
MYO9B-210ENST00000597572 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.58■■■□□ 2.49
MYO9B-210ENST00000597572 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.56■■■□□ 2.48
MYO9B-210ENST00000597572 WDR62O43379 1518 aa30.51■■■□□ 2.47
MYO9B-210ENST00000597572 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
MYO9B-210ENST00000597572 TOPBP1Q92547 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
MYO9B-210ENST00000597572 ABCC8Q09428 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
MYO9B-210ENST00000597572 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.12■■■□□ 2.41
MYO9B-210ENST00000597572 IFT140Q96RY7 1462 aa29.96■■■□□ 2.39
MYO9B-210ENST00000597572 CUX1P39880 1505 aa29.96■■■□□ 2.39
MYO9B-210ENST00000597572 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
MYO9B-210ENST00000597572 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
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MYO9B-210ENST00000597572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
MYO9B-210ENST00000597572 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.81■■■□□ 2.36
MYO9B-210ENST00000597572 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.78■■■□□ 2.36
MYO9B-210ENST00000597572 SOGA1O94964 1423 aa29.76■■■□□ 2.35
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MYO9B-210ENST00000597572 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.69■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 TOP2BQ02880 1626 aa29.67■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 SYNJ1O43426 1573 aa29.66■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 WDR97A6NE52 1622 aa29.64■■■□□ 2.34
MYO9B-210ENST00000597572 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
MYO9B-210ENST00000597572 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.56■■■□□ 2.32
MYO9B-210ENST00000597572 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.45■■■□□ 2.31
MYO9B-210ENST00000597572 OSCARQ8IYS5 282 aa29.44■■■□□ 2.3
MYO9B-210ENST00000597572 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
MYO9B-210ENST00000597572 GRIN2BQ13224 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
MYO9B-210ENST00000597572 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
MYO9B-210ENST00000597572 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.37■■■□□ 2.29
MYO9B-210ENST00000597572 CHD1O14646 1710 aa29.37■■■□□ 2.29
MYO9B-210ENST00000597572 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
MYO9B-210ENST00000597572 SYNJ2O15056 1496 aa29.23■■■□□ 2.27
MYO9B-210ENST00000597572 FBLN2P98095 1184 aa29.21■■■□□ 2.27
MYO9B-210ENST00000597572 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.2■■■□□ 2.26
MYO9B-210ENST00000597572 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
MYO9B-210ENST00000597572 ADAMTS12P58397 1594 aa29.14■■■□□ 2.26
MYO9B-210ENST00000597572 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.09■■■□□ 2.25
MYO9B-210ENST00000597572 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.08■■■□□ 2.25
MYO9B-210ENST00000597572 KIF27Q86VH2 1401 aa29.06■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 GRIN2AQ12879 1464 aa29.05■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 IGF1RP08069 1367 aa29.02■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
MYO9B-210ENST00000597572 ARHGEF11O15085 1522 aa29■■■□□ 2.23
MYO9B-210ENST00000597572 NUP160Q12769 1436 aa28.97■■■□□ 2.23
MYO9B-210ENST00000597572 CEP170Q5SW79 1584 aa28.93■■■□□ 2.22
MYO9B-210ENST00000597572 TRIM41Q8WV44 630 aa28.9■■■□□ 2.22
MYO9B-210ENST00000597572 CUL7Q14999 1698 aa28.89■■■□□ 2.22
MYO9B-210ENST00000597572 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.87■■■□□ 2.21
MYO9B-210ENST00000597572 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.8■■■□□ 2.2
MYO9B-210ENST00000597572 ARAP1Q96P48 1450 aa28.78■■■□□ 2.2
MYO9B-210ENST00000597572 SHROOM2Q13796 1616 aa28.76■■■□□ 2.2
MYO9B-210ENST00000597572 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.69■■■□□ 2.18
MYO9B-210ENST00000597572 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.68■■■□□ 2.18
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