Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.66■■■■■ 5.06
STRN4Q9NRL3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
STRN4Q9NRL3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
STRN4Q9NRL3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
STRN4Q9NRL3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
STRN4Q9NRL3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
STRN4Q9NRL3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
STRN4Q9NRL3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
STRN4Q9NRL3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
STRN4Q9NRL3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
STRN4Q9NRL3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
STRN4Q9NRL3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
STRN4Q9NRL3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
STRN4Q9NRL3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
STRN4Q9NRL3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
STRN4Q9NRL3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
STRN4Q9NRL3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
STRN4Q9NRL3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
STRN4Q9NRL3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
STRN4Q9NRL3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
STRN4Q9NRL3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
STRN4Q9NRL3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
STRN4Q9NRL3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
STRN4Q9NRL3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
STRN4Q9NRL3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
STRN4Q9NRL3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
STRN4Q9NRL3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
STRN4Q9NRL3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
STRN4Q9NRL3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
STRN4Q9NRL3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
STRN4Q9NRL3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
STRN4Q9NRL3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
STRN4Q9NRL3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
STRN4Q9NRL3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
STRN4Q9NRL3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
STRN4Q9NRL3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
STRN4Q9NRL3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
STRN4Q9NRL3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
STRN4Q9NRL3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
STRN4Q9NRL3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
STRN4Q9NRL3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
STRN4Q9NRL3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
STRN4Q9NRL3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
STRN4Q9NRL3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
STRN4Q9NRL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
STRN4Q9NRL3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
STRN4Q9NRL3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
STRN4Q9NRL3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
STRN4Q9NRL3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
STRN4Q9NRL3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
STRN4Q9NRL3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
STRN4Q9NRL3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
STRN4Q9NRL3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
STRN4Q9NRL3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
STRN4Q9NRL3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
STRN4Q9NRL3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
STRN4Q9NRL3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
STRN4Q9NRL3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
STRN4Q9NRL3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
STRN4Q9NRL3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
STRN4Q9NRL3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
STRN4Q9NRL3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
STRN4Q9NRL3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
STRN4Q9NRL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
STRN4Q9NRL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
STRN4Q9NRL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
STRN4Q9NRL3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
STRN4Q9NRL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
STRN4Q9NRL3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
STRN4Q9NRL3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
STRN4Q9NRL3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
STRN4Q9NRL3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
STRN4Q9NRL3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRN4Q9NRL3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRN4Q9NRL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
STRN4Q9NRL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
STRN4Q9NRL3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
STRN4Q9NRL3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
STRN4Q9NRL3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
STRN4Q9NRL3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
STRN4Q9NRL3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
STRN4Q9NRL3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
STRN4Q9NRL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
STRN4Q9NRL3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.03■■■■■ 4
STRN4Q9NRL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
STRN4Q9NRL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
STRN4Q9NRL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms