Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBL0

TNS1, Tensin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1Q9HBL0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
TNS1Q9HBL0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
TNS1Q9HBL0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
TNS1Q9HBL0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TNS1Q9HBL0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TNS1Q9HBL0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TNS1Q9HBL0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TNS1Q9HBL0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TNS1Q9HBL0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TNS1Q9HBL0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TNS1Q9HBL0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
TNS1Q9HBL0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
TNS1Q9HBL0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
TNS1Q9HBL0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
TNS1Q9HBL0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TNS1Q9HBL0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TNS1Q9HBL0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TNS1Q9HBL0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
TNS1Q9HBL0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TNS1Q9HBL0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TNS1Q9HBL0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TNS1Q9HBL0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TNS1Q9HBL0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
TNS1Q9HBL0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TNS1Q9HBL0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TNS1Q9HBL0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
TNS1Q9HBL0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
TNS1Q9HBL0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TNS1Q9HBL0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TNS1Q9HBL0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TNS1Q9HBL0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TNS1Q9HBL0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TNS1Q9HBL0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TNS1Q9HBL0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
TNS1Q9HBL0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
TNS1Q9HBL0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TNS1Q9HBL0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TNS1Q9HBL0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TNS1Q9HBL0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TNS1Q9HBL0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TNS1Q9HBL0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TNS1Q9HBL0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TNS1Q9HBL0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNS1Q9HBL0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNS1Q9HBL0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TNS1Q9HBL0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TNS1Q9HBL0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNS1Q9HBL0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNS1Q9HBL0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNS1Q9HBL0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNS1Q9HBL0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TNS1Q9HBL0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TNS1Q9HBL0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TNS1Q9HBL0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TNS1Q9HBL0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TNS1Q9HBL0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNS1Q9HBL0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNS1Q9HBL0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNS1Q9HBL0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TNS1Q9HBL0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNS1Q9HBL0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNS1Q9HBL0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNS1Q9HBL0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TNS1Q9HBL0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNS1Q9HBL0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TNS1Q9HBL0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNS1Q9HBL0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNS1Q9HBL0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TNS1Q9HBL0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TNS1Q9HBL0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNS1Q9HBL0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TNS1Q9HBL0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNS1Q9HBL0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TNS1Q9HBL0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNS1Q9HBL0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNS1Q9HBL0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNS1Q9HBL0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNS1Q9HBL0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
TNS1Q9HBL0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNS1Q9HBL0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNS1Q9HBL0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNS1Q9HBL0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TNS1Q9HBL0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNS1Q9HBL0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNS1Q9HBL0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TNS1Q9HBL0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TNS1Q9HBL0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNS1Q9HBL0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNS1Q9HBL0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNS1Q9HBL0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNS1Q9HBL0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNS1Q9HBL0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNS1Q9HBL0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TNS1Q9HBL0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms