Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
MCOLN1Q9GZU1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
MCOLN1Q9GZU1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
MCOLN1Q9GZU1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MCOLN1Q9GZU1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
MCOLN1Q9GZU1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MCOLN1Q9GZU1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
MCOLN1Q9GZU1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MCOLN1Q9GZU1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MCOLN1Q9GZU1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
MCOLN1Q9GZU1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
MCOLN1Q9GZU1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
MCOLN1Q9GZU1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MCOLN1Q9GZU1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
MCOLN1Q9GZU1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MCOLN1Q9GZU1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MCOLN1Q9GZU1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MCOLN1Q9GZU1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MCOLN1Q9GZU1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MCOLN1Q9GZU1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
MCOLN1Q9GZU1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MCOLN1Q9GZU1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MCOLN1Q9GZU1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
MCOLN1Q9GZU1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MCOLN1Q9GZU1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MCOLN1Q9GZU1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MCOLN1Q9GZU1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MCOLN1Q9GZU1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MCOLN1Q9GZU1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MCOLN1Q9GZU1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MCOLN1Q9GZU1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MCOLN1Q9GZU1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
MCOLN1Q9GZU1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
MCOLN1Q9GZU1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MCOLN1Q9GZU1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MCOLN1Q9GZU1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MCOLN1Q9GZU1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MCOLN1Q9GZU1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MCOLN1Q9GZU1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MCOLN1Q9GZU1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MCOLN1Q9GZU1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MCOLN1Q9GZU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MCOLN1Q9GZU1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
MCOLN1Q9GZU1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MCOLN1Q9GZU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MCOLN1Q9GZU1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MCOLN1Q9GZU1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
MCOLN1Q9GZU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MCOLN1Q9GZU1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MCOLN1Q9GZU1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MCOLN1Q9GZU1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MCOLN1Q9GZU1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MCOLN1Q9GZU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MCOLN1Q9GZU1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MCOLN1Q9GZU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MCOLN1Q9GZU1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MCOLN1Q9GZU1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MCOLN1Q9GZU1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MCOLN1Q9GZU1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MCOLN1Q9GZU1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MCOLN1Q9GZU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MCOLN1Q9GZU1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MCOLN1Q9GZU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MCOLN1Q9GZU1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MCOLN1Q9GZU1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MCOLN1Q9GZU1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MCOLN1Q9GZU1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
MCOLN1Q9GZU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MCOLN1Q9GZU1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MCOLN1Q9GZU1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MCOLN1Q9GZU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MCOLN1Q9GZU1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MCOLN1Q9GZU1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MCOLN1Q9GZU1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MCOLN1Q9GZU1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MCOLN1Q9GZU1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MCOLN1Q9GZU1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MCOLN1Q9GZU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MCOLN1Q9GZU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MCOLN1Q9GZU1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MCOLN1Q9GZU1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MCOLN1Q9GZU1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MCOLN1Q9GZU1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MCOLN1Q9GZU1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MCOLN1Q9GZU1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MCOLN1Q9GZU1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms