Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms