Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EDEM2Q9BV94 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EDEM2Q9BV94 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EDEM2Q9BV94 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
EDEM2Q9BV94 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
EDEM2Q9BV94 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDEM2Q9BV94 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDEM2Q9BV94 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EDEM2Q9BV94 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDEM2Q9BV94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDEM2Q9BV94 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EDEM2Q9BV94 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EDEM2Q9BV94 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EDEM2Q9BV94 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EDEM2Q9BV94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDEM2Q9BV94 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EDEM2Q9BV94 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
EDEM2Q9BV94 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EDEM2Q9BV94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EDEM2Q9BV94 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDEM2Q9BV94 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDEM2Q9BV94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDEM2Q9BV94 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDEM2Q9BV94 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EDEM2Q9BV94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EDEM2Q9BV94 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EDEM2Q9BV94 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EDEM2Q9BV94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
EDEM2Q9BV94 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EDEM2Q9BV94 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
EDEM2Q9BV94 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EDEM2Q9BV94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDEM2Q9BV94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDEM2Q9BV94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDEM2Q9BV94 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDEM2Q9BV94 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDEM2Q9BV94 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
EDEM2Q9BV94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDEM2Q9BV94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDEM2Q9BV94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDEM2Q9BV94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
EDEM2Q9BV94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDEM2Q9BV94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDEM2Q9BV94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EDEM2Q9BV94 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EDEM2Q9BV94 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EDEM2Q9BV94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EDEM2Q9BV94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDEM2Q9BV94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDEM2Q9BV94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDEM2Q9BV94 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDEM2Q9BV94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDEM2Q9BV94 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EDEM2Q9BV94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EDEM2Q9BV94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EDEM2Q9BV94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDEM2Q9BV94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EDEM2Q9BV94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EDEM2Q9BV94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EDEM2Q9BV94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EDEM2Q9BV94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EDEM2Q9BV94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EDEM2Q9BV94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EDEM2Q9BV94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EDEM2Q9BV94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDEM2Q9BV94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDEM2Q9BV94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDEM2Q9BV94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EDEM2Q9BV94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EDEM2Q9BV94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EDEM2Q9BV94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDEM2Q9BV94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDEM2Q9BV94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDEM2Q9BV94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDEM2Q9BV94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDEM2Q9BV94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDEM2Q9BV94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDEM2Q9BV94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EDEM2Q9BV94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDEM2Q9BV94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDEM2Q9BV94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDEM2Q9BV94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDEM2Q9BV94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms