Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZBED2Q9BTP6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZBED2Q9BTP6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZBED2Q9BTP6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZBED2Q9BTP6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZBED2Q9BTP6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZBED2Q9BTP6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZBED2Q9BTP6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZBED2Q9BTP6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ZBED2Q9BTP6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZBED2Q9BTP6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZBED2Q9BTP6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZBED2Q9BTP6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZBED2Q9BTP6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZBED2Q9BTP6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZBED2Q9BTP6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZBED2Q9BTP6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZBED2Q9BTP6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZBED2Q9BTP6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZBED2Q9BTP6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZBED2Q9BTP6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZBED2Q9BTP6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZBED2Q9BTP6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZBED2Q9BTP6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZBED2Q9BTP6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZBED2Q9BTP6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZBED2Q9BTP6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZBED2Q9BTP6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZBED2Q9BTP6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZBED2Q9BTP6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZBED2Q9BTP6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZBED2Q9BTP6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZBED2Q9BTP6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZBED2Q9BTP6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZBED2Q9BTP6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZBED2Q9BTP6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZBED2Q9BTP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZBED2Q9BTP6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ZBED2Q9BTP6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZBED2Q9BTP6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZBED2Q9BTP6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZBED2Q9BTP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZBED2Q9BTP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ZBED2Q9BTP6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZBED2Q9BTP6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZBED2Q9BTP6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZBED2Q9BTP6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED2Q9BTP6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZBED2Q9BTP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZBED2Q9BTP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBED2Q9BTP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBED2Q9BTP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZBED2Q9BTP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBED2Q9BTP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZBED2Q9BTP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZBED2Q9BTP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED2Q9BTP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBED2Q9BTP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED2Q9BTP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED2Q9BTP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED2Q9BTP6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED2Q9BTP6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZBED2Q9BTP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED2Q9BTP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZBED2Q9BTP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED2Q9BTP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED2Q9BTP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED2Q9BTP6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED2Q9BTP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZBED2Q9BTP6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZBED2Q9BTP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED2Q9BTP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED2Q9BTP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZBED2Q9BTP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED2Q9BTP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZBED2Q9BTP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED2Q9BTP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED2Q9BTP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED2Q9BTP6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBED2Q9BTP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED2Q9BTP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZBED2Q9BTP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZBED2Q9BTP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZBED2Q9BTP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZBED2Q9BTP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED2Q9BTP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZBED2Q9BTP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZBED2Q9BTP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZBED2Q9BTP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZBED2Q9BTP6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZBED2Q9BTP6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZBED2Q9BTP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZBED2Q9BTP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED2Q9BTP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZBED2Q9BTP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms