Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SYT17Q9BSW7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SYT17Q9BSW7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SYT17Q9BSW7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SYT17Q9BSW7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SYT17Q9BSW7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SYT17Q9BSW7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SYT17Q9BSW7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SYT17Q9BSW7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYT17Q9BSW7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SYT17Q9BSW7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYT17Q9BSW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYT17Q9BSW7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYT17Q9BSW7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYT17Q9BSW7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYT17Q9BSW7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYT17Q9BSW7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYT17Q9BSW7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SYT17Q9BSW7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SYT17Q9BSW7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SYT17Q9BSW7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYT17Q9BSW7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYT17Q9BSW7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
SYT17Q9BSW7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYT17Q9BSW7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SYT17Q9BSW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYT17Q9BSW7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SYT17Q9BSW7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SYT17Q9BSW7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYT17Q9BSW7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYT17Q9BSW7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYT17Q9BSW7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SYT17Q9BSW7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SYT17Q9BSW7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SYT17Q9BSW7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SYT17Q9BSW7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SYT17Q9BSW7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
SYT17Q9BSW7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYT17Q9BSW7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYT17Q9BSW7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYT17Q9BSW7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SYT17Q9BSW7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYT17Q9BSW7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYT17Q9BSW7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYT17Q9BSW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYT17Q9BSW7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYT17Q9BSW7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYT17Q9BSW7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SYT17Q9BSW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYT17Q9BSW7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SYT17Q9BSW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SYT17Q9BSW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYT17Q9BSW7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SYT17Q9BSW7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SYT17Q9BSW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SYT17Q9BSW7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SYT17Q9BSW7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYT17Q9BSW7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYT17Q9BSW7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYT17Q9BSW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYT17Q9BSW7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SYT17Q9BSW7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SYT17Q9BSW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SYT17Q9BSW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYT17Q9BSW7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SYT17Q9BSW7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SYT17Q9BSW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYT17Q9BSW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYT17Q9BSW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SYT17Q9BSW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYT17Q9BSW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYT17Q9BSW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYT17Q9BSW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SYT17Q9BSW7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SYT17Q9BSW7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYT17Q9BSW7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYT17Q9BSW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYT17Q9BSW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYT17Q9BSW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SYT17Q9BSW7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYT17Q9BSW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYT17Q9BSW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYT17Q9BSW7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SYT17Q9BSW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYT17Q9BSW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYT17Q9BSW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SYT17Q9BSW7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYT17Q9BSW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYT17Q9BSW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms