Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
UHRF1Q96T88 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
UHRF1Q96T88 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
UHRF1Q96T88 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
UHRF1Q96T88 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
UHRF1Q96T88 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
UHRF1Q96T88 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
UHRF1Q96T88 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
UHRF1Q96T88 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
UHRF1Q96T88 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
UHRF1Q96T88 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
UHRF1Q96T88 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
UHRF1Q96T88 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
UHRF1Q96T88 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
UHRF1Q96T88 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
UHRF1Q96T88 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
UHRF1Q96T88 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UHRF1Q96T88 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UHRF1Q96T88 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UHRF1Q96T88 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UHRF1Q96T88 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UHRF1Q96T88 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
UHRF1Q96T88 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
UHRF1Q96T88 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UHRF1Q96T88 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
UHRF1Q96T88 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UHRF1Q96T88 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UHRF1Q96T88 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UHRF1Q96T88 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UHRF1Q96T88 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UHRF1Q96T88 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UHRF1Q96T88 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UHRF1Q96T88 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
UHRF1Q96T88 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
UHRF1Q96T88 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
UHRF1Q96T88 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
UHRF1Q96T88 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
UHRF1Q96T88 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
UHRF1Q96T88 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UHRF1Q96T88 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UHRF1Q96T88 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UHRF1Q96T88 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
UHRF1Q96T88 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UHRF1Q96T88 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UHRF1Q96T88 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UHRF1Q96T88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UHRF1Q96T88 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
UHRF1Q96T88 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
UHRF1Q96T88 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UHRF1Q96T88 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
UHRF1Q96T88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UHRF1Q96T88 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
UHRF1Q96T88 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UHRF1Q96T88 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UHRF1Q96T88 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UHRF1Q96T88 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
UHRF1Q96T88 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UHRF1Q96T88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UHRF1Q96T88 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UHRF1Q96T88 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UHRF1Q96T88 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UHRF1Q96T88 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UHRF1Q96T88 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
UHRF1Q96T88 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UHRF1Q96T88 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UHRF1Q96T88 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UHRF1Q96T88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
UHRF1Q96T88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UHRF1Q96T88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
UHRF1Q96T88 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
UHRF1Q96T88 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UHRF1Q96T88 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UHRF1Q96T88 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UHRF1Q96T88 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UHRF1Q96T88 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UHRF1Q96T88 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UHRF1Q96T88 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
UHRF1Q96T88 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UHRF1Q96T88 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
UHRF1Q96T88 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
UHRF1Q96T88 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
UHRF1Q96T88 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
UHRF1Q96T88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
UHRF1Q96T88 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
UHRF1Q96T88 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
UHRF1Q96T88 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
UHRF1Q96T88 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
UHRF1Q96T88 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
UHRF1Q96T88 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
UHRF1Q96T88 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
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