Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SLC9A7Q96T83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SLC9A7Q96T83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLC9A7Q96T83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC9A7Q96T83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLC9A7Q96T83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SLC9A7Q96T83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SLC9A7Q96T83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLC9A7Q96T83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLC9A7Q96T83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SLC9A7Q96T83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SLC9A7Q96T83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SLC9A7Q96T83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SLC9A7Q96T83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SLC9A7Q96T83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SLC9A7Q96T83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SLC9A7Q96T83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SLC9A7Q96T83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SLC9A7Q96T83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SLC9A7Q96T83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLC9A7Q96T83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLC9A7Q96T83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLC9A7Q96T83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SLC9A7Q96T83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLC9A7Q96T83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SLC9A7Q96T83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SLC9A7Q96T83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC9A7Q96T83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC9A7Q96T83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC9A7Q96T83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SLC9A7Q96T83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC9A7Q96T83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC9A7Q96T83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC9A7Q96T83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC9A7Q96T83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC9A7Q96T83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC9A7Q96T83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC9A7Q96T83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC9A7Q96T83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC9A7Q96T83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SLC9A7Q96T83 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC9A7Q96T83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC9A7Q96T83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC9A7Q96T83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC9A7Q96T83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC9A7Q96T83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC9A7Q96T83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC9A7Q96T83 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC9A7Q96T83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC9A7Q96T83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC9A7Q96T83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC9A7Q96T83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC9A7Q96T83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC9A7Q96T83 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC9A7Q96T83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC9A7Q96T83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLC9A7Q96T83 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC9A7Q96T83 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC9A7Q96T83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SLC9A7Q96T83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SLC9A7Q96T83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SLC9A7Q96T83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC9A7Q96T83 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC9A7Q96T83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC9A7Q96T83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC9A7Q96T83 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC9A7Q96T83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC9A7Q96T83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC9A7Q96T83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC9A7Q96T83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC9A7Q96T83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC9A7Q96T83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC9A7Q96T83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC9A7Q96T83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC9A7Q96T83 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9A7Q96T83 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC9A7Q96T83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC9A7Q96T83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLC9A7Q96T83 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC9A7Q96T83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC9A7Q96T83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC9A7Q96T83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC9A7Q96T83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC9A7Q96T83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLC9A7Q96T83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9A7Q96T83 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC9A7Q96T83 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms