Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.21■■■■■ 6.75
ARAP1Q96P48 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC56.68■■■■■ 6.66
ARAP1Q96P48 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.1■■■■■ 6.57
ARAP1Q96P48 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
ARAP1Q96P48 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
ARAP1Q96P48 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
ARAP1Q96P48 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.86■■■■■ 6.37
ARAP1Q96P48 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.51■■■■■ 6.32
ARAP1Q96P48 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC54.49■■■■■ 6.31
ARAP1Q96P48 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.2■■■■■ 6.27
ARAP1Q96P48 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.16■■■■■ 6.26
ARAP1Q96P48 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
ARAP1Q96P48 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.85■■■■■ 6.21
ARAP1Q96P48 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.58■■■■■ 6.17
ARAP1Q96P48 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
ARAP1Q96P48 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.46■■■■■ 6.15
ARAP1Q96P48 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.31■■■■■ 6.12
ARAP1Q96P48 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.09■■■■■ 6.09
ARAP1Q96P48 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
ARAP1Q96P48 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
ARAP1Q96P48 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.79■■■■■ 6.04
ARAP1Q96P48 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC52.75■■■■■ 6.04
ARAP1Q96P48 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
ARAP1Q96P48 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
ARAP1Q96P48 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.56■■■■■ 6
ARAP1Q96P48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
ARAP1Q96P48 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
ARAP1Q96P48 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.36■■■■■ 5.97
ARAP1Q96P48 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.34■■■■■ 5.97
ARAP1Q96P48 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.16■■■■■ 5.94
ARAP1Q96P48 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.84■■■■■ 5.89
ARAP1Q96P48 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
ARAP1Q96P48 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
ARAP1Q96P48 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.66■■■■■ 5.86
ARAP1Q96P48 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.55■■■■■ 5.84
ARAP1Q96P48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.5■■■■■ 5.84
ARAP1Q96P48 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.43■■■■■ 5.82
ARAP1Q96P48 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.43■■■■■ 5.82
ARAP1Q96P48 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.34■■■■■ 5.81
ARAP1Q96P48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
ARAP1Q96P48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51■■■■■ 5.75
ARAP1Q96P48 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
ARAP1Q96P48 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
ARAP1Q96P48 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
ARAP1Q96P48 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
ARAP1Q96P48 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
ARAP1Q96P48 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ARAP1Q96P48 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ARAP1Q96P48 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.71■■■■■ 5.71
ARAP1Q96P48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
ARAP1Q96P48 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.57■■■■■ 5.69
ARAP1Q96P48 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
ARAP1Q96P48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
ARAP1Q96P48 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
ARAP1Q96P48 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
ARAP1Q96P48 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.35■■■■■ 5.65
ARAP1Q96P48 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50.33■■■■■ 5.65
ARAP1Q96P48 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.28■■■■■ 5.64
ARAP1Q96P48 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.24■■■■■ 5.63
ARAP1Q96P48 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
ARAP1Q96P48 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
ARAP1Q96P48 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ARAP1Q96P48 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
ARAP1Q96P48 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
ARAP1Q96P48 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
ARAP1Q96P48 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
ARAP1Q96P48 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.84■■■■■ 5.57
ARAP1Q96P48 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
ARAP1Q96P48 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
ARAP1Q96P48 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC49.74■■■■■ 5.55
ARAP1Q96P48 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
ARAP1Q96P48 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
ARAP1Q96P48 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
ARAP1Q96P48 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
ARAP1Q96P48 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
ARAP1Q96P48 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ARAP1Q96P48 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
ARAP1Q96P48 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
ARAP1Q96P48 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
ARAP1Q96P48 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.54■■■■■ 5.52
ARAP1Q96P48 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
ARAP1Q96P48 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ARAP1Q96P48 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ARAP1Q96P48 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
ARAP1Q96P48 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ARAP1Q96P48 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
ARAP1Q96P48 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
ARAP1Q96P48 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
ARAP1Q96P48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ARAP1Q96P48 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ARAP1Q96P48 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
ARAP1Q96P48 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
ARAP1Q96P48 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ARAP1Q96P48 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ARAP1Q96P48 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
ARAP1Q96P48 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
ARAP1Q96P48 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC49.12■■■■■ 5.45
ARAP1Q96P48 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
ARAP1Q96P48 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.08■■■■■ 5.45
ARAP1Q96P48 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.05■■■■■ 5.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 424.7 ms