Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
GAB3Q8WWW8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAB3Q8WWW8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAB3Q8WWW8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GAB3Q8WWW8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAB3Q8WWW8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAB3Q8WWW8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GAB3Q8WWW8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GAB3Q8WWW8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GAB3Q8WWW8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GAB3Q8WWW8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GAB3Q8WWW8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GAB3Q8WWW8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAB3Q8WWW8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAB3Q8WWW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAB3Q8WWW8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GAB3Q8WWW8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GAB3Q8WWW8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GAB3Q8WWW8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GAB3Q8WWW8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAB3Q8WWW8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GAB3Q8WWW8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GAB3Q8WWW8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GAB3Q8WWW8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GAB3Q8WWW8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GAB3Q8WWW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GAB3Q8WWW8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAB3Q8WWW8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAB3Q8WWW8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAB3Q8WWW8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GAB3Q8WWW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GAB3Q8WWW8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
GAB3Q8WWW8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAB3Q8WWW8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAB3Q8WWW8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAB3Q8WWW8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAB3Q8WWW8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GAB3Q8WWW8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GAB3Q8WWW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAB3Q8WWW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GAB3Q8WWW8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GAB3Q8WWW8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GAB3Q8WWW8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAB3Q8WWW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GAB3Q8WWW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GAB3Q8WWW8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAB3Q8WWW8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAB3Q8WWW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAB3Q8WWW8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GAB3Q8WWW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GAB3Q8WWW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GAB3Q8WWW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GAB3Q8WWW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAB3Q8WWW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAB3Q8WWW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAB3Q8WWW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAB3Q8WWW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAB3Q8WWW8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAB3Q8WWW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAB3Q8WWW8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAB3Q8WWW8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAB3Q8WWW8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GAB3Q8WWW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GAB3Q8WWW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GAB3Q8WWW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GAB3Q8WWW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GAB3Q8WWW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GAB3Q8WWW8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GAB3Q8WWW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAB3Q8WWW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAB3Q8WWW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAB3Q8WWW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GAB3Q8WWW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GAB3Q8WWW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GAB3Q8WWW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GAB3Q8WWW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GAB3Q8WWW8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GAB3Q8WWW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAB3Q8WWW8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAB3Q8WWW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAB3Q8WWW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GAB3Q8WWW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GAB3Q8WWW8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GAB3Q8WWW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GAB3Q8WWW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAB3Q8WWW8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAB3Q8WWW8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAB3Q8WWW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GAB3Q8WWW8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GAB3Q8WWW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GAB3Q8WWW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAB3Q8WWW8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAB3Q8WWW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAB3Q8WWW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
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