Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
USP33Q8TEY7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP33Q8TEY7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP33Q8TEY7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP33Q8TEY7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP33Q8TEY7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP33Q8TEY7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
USP33Q8TEY7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP33Q8TEY7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP33Q8TEY7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP33Q8TEY7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP33Q8TEY7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP33Q8TEY7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP33Q8TEY7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP33Q8TEY7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP33Q8TEY7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP33Q8TEY7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP33Q8TEY7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
USP33Q8TEY7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP33Q8TEY7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP33Q8TEY7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP33Q8TEY7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP33Q8TEY7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP33Q8TEY7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP33Q8TEY7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP33Q8TEY7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP33Q8TEY7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP33Q8TEY7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP33Q8TEY7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USP33Q8TEY7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USP33Q8TEY7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USP33Q8TEY7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USP33Q8TEY7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP33Q8TEY7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP33Q8TEY7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP33Q8TEY7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
USP33Q8TEY7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP33Q8TEY7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP33Q8TEY7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP33Q8TEY7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP33Q8TEY7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP33Q8TEY7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP33Q8TEY7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP33Q8TEY7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
USP33Q8TEY7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP33Q8TEY7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
USP33Q8TEY7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
USP33Q8TEY7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP33Q8TEY7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP33Q8TEY7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP33Q8TEY7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP33Q8TEY7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP33Q8TEY7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP33Q8TEY7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP33Q8TEY7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP33Q8TEY7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP33Q8TEY7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP33Q8TEY7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
USP33Q8TEY7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP33Q8TEY7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP33Q8TEY7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP33Q8TEY7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP33Q8TEY7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP33Q8TEY7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP33Q8TEY7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP33Q8TEY7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP33Q8TEY7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP33Q8TEY7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
USP33Q8TEY7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP33Q8TEY7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP33Q8TEY7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP33Q8TEY7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP33Q8TEY7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP33Q8TEY7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP33Q8TEY7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP33Q8TEY7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP33Q8TEY7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP33Q8TEY7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP33Q8TEY7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP33Q8TEY7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP33Q8TEY7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP33Q8TEY7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP33Q8TEY7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP33Q8TEY7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP33Q8TEY7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP33Q8TEY7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP33Q8TEY7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP33Q8TEY7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms