RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597229.1

ZNF358-202, Transcript of zinc finger protein 358, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZNF358, Length 1,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358-202ENST00000597229 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.6■■■■■ 8.57
ZNF358-202ENST00000597229 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.5■■■■■ 7.11
ZNF358-202ENST00000597229 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.79■■■■■ 6.84
ZNF358-202ENST00000597229 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.69■■■■■ 6.67
ZNF358-202ENST00000597229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.62■■■■■ 6.65
ZNF358-202ENST00000597229 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.5■■■■■ 6.63
ZNF358-202ENST00000597229 ABCC9O60706 1549 aa55.8■■■■■ 6.52
ZNF358-202ENST00000597229 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.74■■■■■ 6.51
ZNF358-202ENST00000597229 NACADO15069 1562 aa55.24■■■■■ 6.43
ZNF358-202ENST00000597229 SCRIBQ14160 1630 aa54.88■■■■■ 6.38
ZNF358-202ENST00000597229 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.68■■■■■ 6.34
ZNF358-202ENST00000597229 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.64■■■■■ 6.34
ZNF358-202ENST00000597229 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.67■■■■■ 6.18
ZNF358-202ENST00000597229 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.49■■■■■ 6.15
ZNF358-202ENST00000597229 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.3■■■■■ 6.12
ZNF358-202ENST00000597229 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.07■■■■■ 6.09
ZNF358-202ENST00000597229 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.04■■■■■ 6.08
ZNF358-202ENST00000597229 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.9■■■■■ 6.06
ZNF358-202ENST00000597229 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.81■■■■■ 6.05
ZNF358-202ENST00000597229 WIZO95785 1651 aa52.69■■■■■ 6.03
ZNF358-202ENST00000597229 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.63■■■■■ 6.02
ZNF358-202ENST00000597229 SMARCA4P51532 1647 aa52.62■■■■■ 6.01
ZNF358-202ENST00000597229 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.11■■■■■ 5.93
ZNF358-202ENST00000597229 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.94■■■■■ 5.9
ZNF358-202ENST00000597229 SMARCA2P51531 1590 aa51.68■■■■■ 5.86
ZNF358-202ENST00000597229 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.6■■■■■ 5.85
ZNF358-202ENST00000597229 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.59■■■■■ 5.85
ZNF358-202ENST00000597229 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.57■■■■■ 5.85
ZNF358-202ENST00000597229 TRIM41Q8WV44 630 aa51.34■■■■■ 5.81
ZNF358-202ENST00000597229 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
ZNF358-202ENST00000597229 NCAPD3P42695 1498 aa51.01■■■■■ 5.76
ZNF358-202ENST00000597229 HMGXB3Q12766 1538 aa50.99■■■■■ 5.75
ZNF358-202ENST00000597229 ABCC8Q09428 1581 aa50.79■■■■■ 5.72
ZNF358-202ENST00000597229 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.68■■■■■ 5.7
ZNF358-202ENST00000597229 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.47■■■■■ 5.67
ZNF358-202ENST00000597229 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.46■■■■■ 5.67
ZNF358-202ENST00000597229 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.3■■■■■ 5.64
ZNF358-202ENST00000597229 SYNJ1O43426 1573 aa50.14■■■■■ 5.62
ZNF358-202ENST00000597229 CFTRP13569 1480 aa50.06■■■■■ 5.6
ZNF358-202ENST00000597229 SOGA1O94964 1423 aa49.93■■■■■ 5.58
ZNF358-202ENST00000597229 PRDM2Q13029 1718 aa49.89■■■■■ 5.58
ZNF358-202ENST00000597229 EEA1Q15075 1411 aa49.88■■■■■ 5.58
ZNF358-202ENST00000597229 TOP2BQ02880 1626 aa49.85■■■■■ 5.57
ZNF358-202ENST00000597229 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.8■■■■■ 5.56
ZNF358-202ENST00000597229 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.79■■■■■ 5.56
ZNF358-202ENST00000597229 EHMT2Q96KQ7 1210 aa49.78■■■■■ 5.56
ZNF358-202ENST00000597229 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.74■■■■■ 5.55
ZNF358-202ENST00000597229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.61■■■■■ 5.53
ZNF358-202ENST00000597229 CUX1P39880 1505 aa49.58■■■■■ 5.53
ZNF358-202ENST00000597229 KIF21BO75037 1637 aa49.28■■■■■ 5.48
ZNF358-202ENST00000597229 GOLGA3Q08378 1498 aa49.27■■■■■ 5.48
ZNF358-202ENST00000597229 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.24■■■■■ 5.47
ZNF358-202ENST00000597229 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.22■■■■■ 5.47
ZNF358-202ENST00000597229 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.2■■■■■ 5.47
ZNF358-202ENST00000597229 NESP48681 1621 aa49.18■■■■■ 5.46
ZNF358-202ENST00000597229 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.16■■■■■ 5.46
ZNF358-202ENST00000597229 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.11■■■■■ 5.45
ZNF358-202ENST00000597229 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.08■■■■■ 5.45
ZNF358-202ENST00000597229 CEP162Q5TB80 1403 aa49.06■■■■■ 5.44
ZNF358-202ENST00000597229 PCGF6Q9BYE7 350 aa49.02■■■■■ 5.44
ZNF358-202ENST00000597229 KIF27Q86VH2 1401 aa48.97■■■■■ 5.43
ZNF358-202ENST00000597229 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.91■■■■■ 5.42
ZNF358-202ENST00000597229 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.9■■■■■ 5.42
ZNF358-202ENST00000597229 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.88■■■■■ 5.42
ZNF358-202ENST00000597229 PRXQ9BXM0 1461 aa48.83■■■■■ 5.41
ZNF358-202ENST00000597229 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
ZNF358-202ENST00000597229 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.81■■■■■ 5.4
ZNF358-202ENST00000597229 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.81■■■■■ 5.4
ZNF358-202ENST00000597229 TOPBP1Q92547 1522 aa48.76■■■■■ 5.4
ZNF358-202ENST00000597229 CUX2O14529 1486 aa48.72■■■■■ 5.39
ZNF358-202ENST00000597229 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
ZNF358-202ENST00000597229 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
ZNF358-202ENST00000597229 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.58■■■■■ 5.37
ZNF358-202ENST00000597229 CLIP1P30622 1438 aa48.5■■■■■ 5.35
ZNF358-202ENST00000597229 IGF1RP08069 1367 aa48.49■■■■■ 5.35
ZNF358-202ENST00000597229 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.47■■■■■ 5.35
ZNF358-202ENST00000597229 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.47■■■■■ 5.35
ZNF358-202ENST00000597229 WDR97A6NE52 1622 aa48.32■■■■■ 5.33
ZNF358-202ENST00000597229 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
ZNF358-202ENST00000597229 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.27■■■■■ 5.32
ZNF358-202ENST00000597229 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.18■■■■■ 5.3
ZNF358-202ENST00000597229 HRCP23327 699 aa48.15■■■■■ 5.3
ZNF358-202ENST00000597229 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
ZNF358-202ENST00000597229 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.12■■■■■ 5.29
ZNF358-202ENST00000597229 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.07■■■■■ 5.29
ZNF358-202ENST00000597229 CUL7Q14999 1698 aa48.05■■■■■ 5.28
ZNF358-202ENST00000597229 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
ZNF358-202ENST00000597229 ARAP1Q96P48 1450 aa48■■■■■ 5.27
ZNF358-202ENST00000597229 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
ZNF358-202ENST00000597229 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.92■■■■■ 5.26
ZNF358-202ENST00000597229 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.86■■■■■ 5.25
ZNF358-202ENST00000597229 WDR62O43379 1518 aa47.84■■■■■ 5.25
ZNF358-202ENST00000597229 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
ZNF358-202ENST00000597229 ERCC6Q03468 1493 aa47.77■■■■■ 5.24
ZNF358-202ENST00000597229 APLP2Q06481 763 aa47.74■■■■■ 5.23
ZNF358-202ENST00000597229 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.65■■■■■ 5.22
ZNF358-202ENST00000597229 IFT140Q96RY7 1462 aa47.63■■■■■ 5.22
ZNF358-202ENST00000597229 PBRM1Q86U86 1689 aa47.63■■■■■ 5.21
ZNF358-202ENST00000597229 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
ZNF358-202ENST00000597229 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.54■■■■■ 5.26e-7■■■■■ 28.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms