Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER5

ARHGEF40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF40Q8TER5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.99■■■■■ 6.07
ARHGEF40Q8TER5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.55■■■■■ 6
ARHGEF40Q8TER5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.35■■■■■ 5.97
ARHGEF40Q8TER5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
ARHGEF40Q8TER5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
ARHGEF40Q8TER5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
ARHGEF40Q8TER5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ARHGEF40Q8TER5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ARHGEF40Q8TER5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
ARHGEF40Q8TER5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
ARHGEF40Q8TER5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.23■■■■■ 5.63
ARHGEF40Q8TER5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.15■■■■■ 5.62
ARHGEF40Q8TER5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
ARHGEF40Q8TER5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
ARHGEF40Q8TER5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
ARHGEF40Q8TER5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
ARHGEF40Q8TER5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
ARHGEF40Q8TER5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
ARHGEF40Q8TER5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
ARHGEF40Q8TER5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
ARHGEF40Q8TER5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ARHGEF40Q8TER5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ARHGEF40Q8TER5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
ARHGEF40Q8TER5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
ARHGEF40Q8TER5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
ARHGEF40Q8TER5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
ARHGEF40Q8TER5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
ARHGEF40Q8TER5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.45■■■■■ 5.35
ARHGEF40Q8TER5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
ARHGEF40Q8TER5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
ARHGEF40Q8TER5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
ARHGEF40Q8TER5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
ARHGEF40Q8TER5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
ARHGEF40Q8TER5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
ARHGEF40Q8TER5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
ARHGEF40Q8TER5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
ARHGEF40Q8TER5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
ARHGEF40Q8TER5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ARHGEF40Q8TER5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
ARHGEF40Q8TER5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
ARHGEF40Q8TER5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
ARHGEF40Q8TER5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARHGEF40Q8TER5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
ARHGEF40Q8TER5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
ARHGEF40Q8TER5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ARHGEF40Q8TER5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ARHGEF40Q8TER5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
ARHGEF40Q8TER5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
ARHGEF40Q8TER5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ARHGEF40Q8TER5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ARHGEF40Q8TER5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ARHGEF40Q8TER5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.67■■■■■ 5.06
ARHGEF40Q8TER5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ARHGEF40Q8TER5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
ARHGEF40Q8TER5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARHGEF40Q8TER5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARHGEF40Q8TER5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ARHGEF40Q8TER5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
ARHGEF40Q8TER5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARHGEF40Q8TER5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ARHGEF40Q8TER5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ARHGEF40Q8TER5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ARHGEF40Q8TER5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.26■■■■■ 5
ARHGEF40Q8TER5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF40Q8TER5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
ARHGEF40Q8TER5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ARHGEF40Q8TER5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARHGEF40Q8TER5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ARHGEF40Q8TER5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ARHGEF40Q8TER5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
ARHGEF40Q8TER5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
ARHGEF40Q8TER5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
ARHGEF40Q8TER5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
ARHGEF40Q8TER5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARHGEF40Q8TER5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
ARHGEF40Q8TER5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ARHGEF40Q8TER5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
ARHGEF40Q8TER5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
ARHGEF40Q8TER5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
ARHGEF40Q8TER5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARHGEF40Q8TER5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
ARHGEF40Q8TER5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ARHGEF40Q8TER5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ARHGEF40Q8TER5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ARHGEF40Q8TER5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
ARHGEF40Q8TER5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
ARHGEF40Q8TER5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ARHGEF40Q8TER5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ARHGEF40Q8TER5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
ARHGEF40Q8TER5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ARHGEF40Q8TER5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ARHGEF40Q8TER5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ARHGEF40Q8TER5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ARHGEF40Q8TER5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
ARHGEF40Q8TER5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
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