Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE99

PXYLP1, 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1Q8TE99 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PXYLP1Q8TE99 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PXYLP1Q8TE99 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PXYLP1Q8TE99 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PXYLP1Q8TE99 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PXYLP1Q8TE99 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PXYLP1Q8TE99 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PXYLP1Q8TE99 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PXYLP1Q8TE99 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PXYLP1Q8TE99 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PXYLP1Q8TE99 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PXYLP1Q8TE99 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PXYLP1Q8TE99 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PXYLP1Q8TE99 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PXYLP1Q8TE99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PXYLP1Q8TE99 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PXYLP1Q8TE99 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PXYLP1Q8TE99 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PXYLP1Q8TE99 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PXYLP1Q8TE99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PXYLP1Q8TE99 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PXYLP1Q8TE99 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PXYLP1Q8TE99 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PXYLP1Q8TE99 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PXYLP1Q8TE99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PXYLP1Q8TE99 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PXYLP1Q8TE99 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PXYLP1Q8TE99 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PXYLP1Q8TE99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PXYLP1Q8TE99 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PXYLP1Q8TE99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PXYLP1Q8TE99 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PXYLP1Q8TE99 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PXYLP1Q8TE99 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PXYLP1Q8TE99 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PXYLP1Q8TE99 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PXYLP1Q8TE99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PXYLP1Q8TE99 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PXYLP1Q8TE99 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PXYLP1Q8TE99 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PXYLP1Q8TE99 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PXYLP1Q8TE99 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PXYLP1Q8TE99 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PXYLP1Q8TE99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PXYLP1Q8TE99 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PXYLP1Q8TE99 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PXYLP1Q8TE99 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PXYLP1Q8TE99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PXYLP1Q8TE99 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PXYLP1Q8TE99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PXYLP1Q8TE99 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PXYLP1Q8TE99 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PXYLP1Q8TE99 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PXYLP1Q8TE99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PXYLP1Q8TE99 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PXYLP1Q8TE99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PXYLP1Q8TE99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PXYLP1Q8TE99 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PXYLP1Q8TE99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PXYLP1Q8TE99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PXYLP1Q8TE99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PXYLP1Q8TE99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PXYLP1Q8TE99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PXYLP1Q8TE99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PXYLP1Q8TE99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PXYLP1Q8TE99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PXYLP1Q8TE99 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PXYLP1Q8TE99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PXYLP1Q8TE99 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PXYLP1Q8TE99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PXYLP1Q8TE99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PXYLP1Q8TE99 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PXYLP1Q8TE99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PXYLP1Q8TE99 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PXYLP1Q8TE99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PXYLP1Q8TE99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PXYLP1Q8TE99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PXYLP1Q8TE99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PXYLP1Q8TE99 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PXYLP1Q8TE99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PXYLP1Q8TE99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PXYLP1Q8TE99 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PXYLP1Q8TE99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PXYLP1Q8TE99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PXYLP1Q8TE99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PXYLP1Q8TE99 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PXYLP1Q8TE99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PXYLP1Q8TE99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PXYLP1Q8TE99 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PXYLP1Q8TE99 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PXYLP1Q8TE99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PXYLP1Q8TE99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PXYLP1Q8TE99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PXYLP1Q8TE99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PXYLP1Q8TE99 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PXYLP1Q8TE99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PXYLP1Q8TE99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PXYLP1Q8TE99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PXYLP1Q8TE99 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PXYLP1Q8TE99 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms