Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC68.63■■■■■ 8.58
RB1CC1Q8TDY2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC67.97■■■■■ 8.47
RB1CC1Q8TDY2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC67.84■■■■■ 8.45
RB1CC1Q8TDY2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.64■■■■■ 8.26
RB1CC1Q8TDY2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC65.73■■■■■ 8.11
RB1CC1Q8TDY2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.72■■■■■ 8.11
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65.44■■■■■ 8.07
RB1CC1Q8TDY2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC65.42■■■■■ 8.06
RB1CC1Q8TDY2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC65.34■■■■■ 8.05
RB1CC1Q8TDY2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.25■■■■■ 8.04
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC64.91■■■■■ 7.98
RB1CC1Q8TDY2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC64.82■■■■■ 7.97
RB1CC1Q8TDY2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC64.61■■■■■ 7.93
RB1CC1Q8TDY2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.5■■■■■ 7.92
RB1CC1Q8TDY2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.33■■■■■ 7.89
RB1CC1Q8TDY2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC64.16■■■■■ 7.86
RB1CC1Q8TDY2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC64.07■■■■■ 7.85
RB1CC1Q8TDY2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.64■■■■■ 7.78
RB1CC1Q8TDY2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC63.51■■■■■ 7.76
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC63.4■■■■■ 7.74
RB1CC1Q8TDY2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.39■■■■■ 7.74
RB1CC1Q8TDY2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC63.39■■■■■ 7.74
RB1CC1Q8TDY2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC63.25■■■■■ 7.72
RB1CC1Q8TDY2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC63.15■■■■■ 7.7
RB1CC1Q8TDY2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.09■■■■■ 7.69
RB1CC1Q8TDY2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC62.95■■■■■ 7.67
RB1CC1Q8TDY2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC62.86■■■■■ 7.65
RB1CC1Q8TDY2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC62.8■■■■■ 7.64
RB1CC1Q8TDY2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC62.74■■■■■ 7.63
RB1CC1Q8TDY2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC62.62■■■■■ 7.62
RB1CC1Q8TDY2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC62.3■■■■■ 7.56
RB1CC1Q8TDY2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.28■■■■■ 7.56
RB1CC1Q8TDY2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC62.05■■■■■ 7.52
RB1CC1Q8TDY2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC61.82■■■■■ 7.49
RB1CC1Q8TDY2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC61.74■■■■■ 7.47
RB1CC1Q8TDY2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC61.48■■■■■ 7.43
RB1CC1Q8TDY2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.37■■■■■ 7.42
RB1CC1Q8TDY2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC61.2■■■■■ 7.39
RB1CC1Q8TDY2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.13■■■■■ 7.38
RB1CC1Q8TDY2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC60.87■■■■■ 7.33
RB1CC1Q8TDY2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC60.84■■■■■ 7.33
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.75■■■■■ 7.32
RB1CC1Q8TDY2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC60.65■■■■■ 7.3
RB1CC1Q8TDY2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC60.65■■■■■ 7.3
RB1CC1Q8TDY2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC60.65■■■■■ 7.3
RB1CC1Q8TDY2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC60.6■■■■■ 7.29
RB1CC1Q8TDY2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.57■■■■■ 7.29
RB1CC1Q8TDY2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC60.55■■■■■ 7.28
RB1CC1Q8TDY2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC60.55■■■■■ 7.28
RB1CC1Q8TDY2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC60.45■■■■■ 7.27
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC60.44■■■■■ 7.27
RB1CC1Q8TDY2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC60.36■■■■■ 7.25
RB1CC1Q8TDY2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC60.35■■■■■ 7.25
RB1CC1Q8TDY2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC60.33■■■■■ 7.25
RB1CC1Q8TDY2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC60.31■■■■■ 7.25
RB1CC1Q8TDY2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.24■■■■■ 7.23
RB1CC1Q8TDY2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC60.2■■■■■ 7.23
RB1CC1Q8TDY2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC60.19■■■■■ 7.23
RB1CC1Q8TDY2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC60.18■■■■■ 7.22
RB1CC1Q8TDY2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.04■■■■■ 7.2
RB1CC1Q8TDY2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC59.98■■■■■ 7.19
RB1CC1Q8TDY2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC59.9■■■■■ 7.18
RB1CC1Q8TDY2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.87■■■■■ 7.18
RB1CC1Q8TDY2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.85■■■■■ 7.17
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC59.74■■■■■ 7.15
RB1CC1Q8TDY2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.66■■■■■ 7.14
RB1CC1Q8TDY2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.65■■■■■ 7.14
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC59.62■■■■■ 7.13
RB1CC1Q8TDY2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC59.49■■■■■ 7.11
RB1CC1Q8TDY2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC59.47■■■■■ 7.11
RB1CC1Q8TDY2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.47■■■■■ 7.11
RB1CC1Q8TDY2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.47■■■■■ 7.11
RB1CC1Q8TDY2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC59.45■■■■■ 7.11
RB1CC1Q8TDY2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC59.28■■■■■ 7.08
RB1CC1Q8TDY2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.27■■■■■ 7.08
RB1CC1Q8TDY2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC59.27■■■■■ 7.08
RB1CC1Q8TDY2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC59.24■■■■■ 7.07
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.23■■■■■ 7.07
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC59.18■■■■■ 7.06
RB1CC1Q8TDY2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC59.18■■■■■ 7.06
RB1CC1Q8TDY2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.12■■■■■ 7.05
RB1CC1Q8TDY2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC59.07■■■■■ 7.05
RB1CC1Q8TDY2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC59.04■■■■■ 7.04
RB1CC1Q8TDY2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC59.01■■■■■ 7.04
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59■■■■■ 7.04
RB1CC1Q8TDY2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59■■■■■ 7.04
RB1CC1Q8TDY2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.95■■■■■ 7.03
RB1CC1Q8TDY2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.95■■■■■ 7.03
RB1CC1Q8TDY2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.94■■■■■ 7.03
RB1CC1Q8TDY2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC58.93■■■■■ 7.02
RB1CC1Q8TDY2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC58.93■■■■■ 7.02
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC58.93■■■■■ 7.02
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC58.93■■■■■ 7.02
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC58.93■■■■■ 7.02
RB1CC1Q8TDY2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.85■■■■■ 7.01
RB1CC1Q8TDY2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC58.81■■■■■ 7.01
RB1CC1Q8TDY2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC58.79■■■■■ 7
RB1CC1Q8TDY2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC58.79■■■■■ 7
RB1CC1Q8TDY2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC58.76■■■■■ 7
RB1CC1Q8TDY2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC58.73■■■■■ 6.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms