Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.59■■■■■ 5.85
PREX1Q8TCU6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.11■■■■■ 5.77
PREX1Q8TCU6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.9■■■■■ 5.74
PREX1Q8TCU6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
PREX1Q8TCU6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
PREX1Q8TCU6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
PREX1Q8TCU6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
PREX1Q8TCU6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
PREX1Q8TCU6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
PREX1Q8TCU6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
PREX1Q8TCU6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
PREX1Q8TCU6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
PREX1Q8TCU6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
PREX1Q8TCU6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
PREX1Q8TCU6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
PREX1Q8TCU6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.5■■■■■ 5.36
PREX1Q8TCU6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
PREX1Q8TCU6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
PREX1Q8TCU6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
PREX1Q8TCU6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
PREX1Q8TCU6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
PREX1Q8TCU6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
PREX1Q8TCU6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
PREX1Q8TCU6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
PREX1Q8TCU6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
PREX1Q8TCU6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
PREX1Q8TCU6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PREX1Q8TCU6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
PREX1Q8TCU6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
PREX1Q8TCU6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
PREX1Q8TCU6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
PREX1Q8TCU6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
PREX1Q8TCU6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
PREX1Q8TCU6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
PREX1Q8TCU6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
PREX1Q8TCU6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
PREX1Q8TCU6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
PREX1Q8TCU6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
PREX1Q8TCU6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
PREX1Q8TCU6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
PREX1Q8TCU6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
PREX1Q8TCU6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
PREX1Q8TCU6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
PREX1Q8TCU6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
PREX1Q8TCU6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PREX1Q8TCU6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
PREX1Q8TCU6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PREX1Q8TCU6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
PREX1Q8TCU6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
PREX1Q8TCU6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PREX1Q8TCU6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PREX1Q8TCU6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
PREX1Q8TCU6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
PREX1Q8TCU6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
PREX1Q8TCU6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PREX1Q8TCU6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PREX1Q8TCU6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PREX1Q8TCU6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
PREX1Q8TCU6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PREX1Q8TCU6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PREX1Q8TCU6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
PREX1Q8TCU6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
PREX1Q8TCU6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
PREX1Q8TCU6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PREX1Q8TCU6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PREX1Q8TCU6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PREX1Q8TCU6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PREX1Q8TCU6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PREX1Q8TCU6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PREX1Q8TCU6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PREX1Q8TCU6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
PREX1Q8TCU6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PREX1Q8TCU6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PREX1Q8TCU6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PREX1Q8TCU6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
PREX1Q8TCU6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PREX1Q8TCU6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
PREX1Q8TCU6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
PREX1Q8TCU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PREX1Q8TCU6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PREX1Q8TCU6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PREX1Q8TCU6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PREX1Q8TCU6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PREX1Q8TCU6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
PREX1Q8TCU6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
PREX1Q8TCU6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
PREX1Q8TCU6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PREX1Q8TCU6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PREX1Q8TCU6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
PREX1Q8TCU6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
PREX1Q8TCU6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PREX1Q8TCU6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
PREX1Q8TCU6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PREX1Q8TCU6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
PREX1Q8TCU6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
PREX1Q8TCU6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PREX1Q8TCU6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PREX1Q8TCU6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
PREX1Q8TCU6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
PREX1Q8TCU6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms