Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7Y1

KIRREL3-AS3, Putative uncharacterized protein KIRREL3-AS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms