Protein–RNA interactions for Protein: Q7L3B6

CDC37L1, Hsp90 co-chaperone Cdc37-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37L1Q7L3B6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC37L1Q7L3B6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CDC37L1Q7L3B6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CDC37L1Q7L3B6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CDC37L1Q7L3B6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CDC37L1Q7L3B6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CDC37L1Q7L3B6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDC37L1Q7L3B6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CDC37L1Q7L3B6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CDC37L1Q7L3B6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CDC37L1Q7L3B6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CDC37L1Q7L3B6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CDC37L1Q7L3B6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDC37L1Q7L3B6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDC37L1Q7L3B6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDC37L1Q7L3B6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CDC37L1Q7L3B6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CDC37L1Q7L3B6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CDC37L1Q7L3B6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDC37L1Q7L3B6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDC37L1Q7L3B6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDC37L1Q7L3B6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDC37L1Q7L3B6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CDC37L1Q7L3B6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDC37L1Q7L3B6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDC37L1Q7L3B6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDC37L1Q7L3B6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CDC37L1Q7L3B6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDC37L1Q7L3B6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDC37L1Q7L3B6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CDC37L1Q7L3B6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CDC37L1Q7L3B6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDC37L1Q7L3B6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDC37L1Q7L3B6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDC37L1Q7L3B6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDC37L1Q7L3B6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDC37L1Q7L3B6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDC37L1Q7L3B6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CDC37L1Q7L3B6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDC37L1Q7L3B6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDC37L1Q7L3B6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CDC37L1Q7L3B6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CDC37L1Q7L3B6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CDC37L1Q7L3B6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDC37L1Q7L3B6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CDC37L1Q7L3B6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDC37L1Q7L3B6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDC37L1Q7L3B6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CDC37L1Q7L3B6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDC37L1Q7L3B6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
CDC37L1Q7L3B6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDC37L1Q7L3B6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDC37L1Q7L3B6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDC37L1Q7L3B6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDC37L1Q7L3B6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDC37L1Q7L3B6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDC37L1Q7L3B6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDC37L1Q7L3B6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDC37L1Q7L3B6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDC37L1Q7L3B6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDC37L1Q7L3B6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC37L1Q7L3B6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDC37L1Q7L3B6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDC37L1Q7L3B6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDC37L1Q7L3B6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDC37L1Q7L3B6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDC37L1Q7L3B6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDC37L1Q7L3B6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDC37L1Q7L3B6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDC37L1Q7L3B6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDC37L1Q7L3B6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDC37L1Q7L3B6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDC37L1Q7L3B6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDC37L1Q7L3B6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDC37L1Q7L3B6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDC37L1Q7L3B6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDC37L1Q7L3B6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDC37L1Q7L3B6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CDC37L1Q7L3B6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms