Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.44■■■■■ 5.03
TOM1L2Q6ZVM7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
TOM1L2Q6ZVM7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TOM1L2Q6ZVM7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
TOM1L2Q6ZVM7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOM1L2Q6ZVM7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOM1L2Q6ZVM7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOM1L2Q6ZVM7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
TOM1L2Q6ZVM7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TOM1L2Q6ZVM7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOM1L2Q6ZVM7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOM1L2Q6ZVM7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOM1L2Q6ZVM7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOM1L2Q6ZVM7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOM1L2Q6ZVM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOM1L2Q6ZVM7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOM1L2Q6ZVM7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOM1L2Q6ZVM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOM1L2Q6ZVM7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOM1L2Q6ZVM7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOM1L2Q6ZVM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TOM1L2Q6ZVM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOM1L2Q6ZVM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOM1L2Q6ZVM7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOM1L2Q6ZVM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOM1L2Q6ZVM7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOM1L2Q6ZVM7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOM1L2Q6ZVM7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TOM1L2Q6ZVM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
TOM1L2Q6ZVM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TOM1L2Q6ZVM7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOM1L2Q6ZVM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOM1L2Q6ZVM7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TOM1L2Q6ZVM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
TOM1L2Q6ZVM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOM1L2Q6ZVM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TOM1L2Q6ZVM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TOM1L2Q6ZVM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOM1L2Q6ZVM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOM1L2Q6ZVM7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOM1L2Q6ZVM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TOM1L2Q6ZVM7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOM1L2Q6ZVM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOM1L2Q6ZVM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOM1L2Q6ZVM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOM1L2Q6ZVM7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOM1L2Q6ZVM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOM1L2Q6ZVM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOM1L2Q6ZVM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOM1L2Q6ZVM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOM1L2Q6ZVM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOM1L2Q6ZVM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOM1L2Q6ZVM7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOM1L2Q6ZVM7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOM1L2Q6ZVM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOM1L2Q6ZVM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOM1L2Q6ZVM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOM1L2Q6ZVM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TOM1L2Q6ZVM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOM1L2Q6ZVM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOM1L2Q6ZVM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOM1L2Q6ZVM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOM1L2Q6ZVM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOM1L2Q6ZVM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOM1L2Q6ZVM7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOM1L2Q6ZVM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOM1L2Q6ZVM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.03■■■■■ 4
TOM1L2Q6ZVM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TOM1L2Q6ZVM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOM1L2Q6ZVM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOM1L2Q6ZVM7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOM1L2Q6ZVM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOM1L2Q6ZVM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOM1L2Q6ZVM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOM1L2Q6ZVM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOM1L2Q6ZVM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOM1L2Q6ZVM7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TOM1L2Q6ZVM7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOM1L2Q6ZVM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOM1L2Q6ZVM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOM1L2Q6ZVM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms