Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS30

NBEAL1, Neurobeachin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAL1Q6ZS30 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBEAL1Q6ZS30 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBEAL1Q6ZS30 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBEAL1Q6ZS30 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBEAL1Q6ZS30 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBEAL1Q6ZS30 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBEAL1Q6ZS30 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBEAL1Q6ZS30 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBEAL1Q6ZS30 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBEAL1Q6ZS30 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBEAL1Q6ZS30 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBEAL1Q6ZS30 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBEAL1Q6ZS30 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBEAL1Q6ZS30 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBEAL1Q6ZS30 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAL1Q6ZS30 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NBEAL1Q6ZS30 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBEAL1Q6ZS30 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAL1Q6ZS30 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBEAL1Q6ZS30 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBEAL1Q6ZS30 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBEAL1Q6ZS30 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBEAL1Q6ZS30 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBEAL1Q6ZS30 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBEAL1Q6ZS30 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBEAL1Q6ZS30 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBEAL1Q6ZS30 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBEAL1Q6ZS30 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBEAL1Q6ZS30 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAL1Q6ZS30 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBEAL1Q6ZS30 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBEAL1Q6ZS30 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBEAL1Q6ZS30 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBEAL1Q6ZS30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBEAL1Q6ZS30 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBEAL1Q6ZS30 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBEAL1Q6ZS30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBEAL1Q6ZS30 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBEAL1Q6ZS30 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBEAL1Q6ZS30 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBEAL1Q6ZS30 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBEAL1Q6ZS30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBEAL1Q6ZS30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAL1Q6ZS30 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAL1Q6ZS30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBEAL1Q6ZS30 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBEAL1Q6ZS30 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBEAL1Q6ZS30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBEAL1Q6ZS30 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAL1Q6ZS30 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAL1Q6ZS30 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAL1Q6ZS30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBEAL1Q6ZS30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBEAL1Q6ZS30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBEAL1Q6ZS30 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBEAL1Q6ZS30 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBEAL1Q6ZS30 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NBEAL1Q6ZS30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NBEAL1Q6ZS30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NBEAL1Q6ZS30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NBEAL1Q6ZS30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBEAL1Q6ZS30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBEAL1Q6ZS30 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBEAL1Q6ZS30 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBEAL1Q6ZS30 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBEAL1Q6ZS30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAL1Q6ZS30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBEAL1Q6ZS30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBEAL1Q6ZS30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBEAL1Q6ZS30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBEAL1Q6ZS30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAL1Q6ZS30 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAL1Q6ZS30 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAL1Q6ZS30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBEAL1Q6ZS30 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBEAL1Q6ZS30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBEAL1Q6ZS30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBEAL1Q6ZS30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NBEAL1Q6ZS30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBEAL1Q6ZS30 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBEAL1Q6ZS30 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBEAL1Q6ZS30 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBEAL1Q6ZS30 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBEAL1Q6ZS30 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NBEAL1Q6ZS30 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBEAL1Q6ZS30 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBEAL1Q6ZS30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBEAL1Q6ZS30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBEAL1Q6ZS30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NBEAL1Q6ZS30 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NBEAL1Q6ZS30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBEAL1Q6ZS30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBEAL1Q6ZS30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NBEAL1Q6ZS30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550 ms