Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
MUC6Q6W4X9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MUC6Q6W4X9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MUC6Q6W4X9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MUC6Q6W4X9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MUC6Q6W4X9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MUC6Q6W4X9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MUC6Q6W4X9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MUC6Q6W4X9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MUC6Q6W4X9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MUC6Q6W4X9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MUC6Q6W4X9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MUC6Q6W4X9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MUC6Q6W4X9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MUC6Q6W4X9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MUC6Q6W4X9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MUC6Q6W4X9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MUC6Q6W4X9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
MUC6Q6W4X9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MUC6Q6W4X9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MUC6Q6W4X9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MUC6Q6W4X9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MUC6Q6W4X9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MUC6Q6W4X9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MUC6Q6W4X9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MUC6Q6W4X9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MUC6Q6W4X9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MUC6Q6W4X9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MUC6Q6W4X9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MUC6Q6W4X9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MUC6Q6W4X9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MUC6Q6W4X9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MUC6Q6W4X9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MUC6Q6W4X9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
MUC6Q6W4X9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MUC6Q6W4X9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MUC6Q6W4X9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MUC6Q6W4X9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MUC6Q6W4X9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MUC6Q6W4X9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MUC6Q6W4X9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MUC6Q6W4X9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MUC6Q6W4X9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
MUC6Q6W4X9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MUC6Q6W4X9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MUC6Q6W4X9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MUC6Q6W4X9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MUC6Q6W4X9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MUC6Q6W4X9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MUC6Q6W4X9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MUC6Q6W4X9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MUC6Q6W4X9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MUC6Q6W4X9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MUC6Q6W4X9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MUC6Q6W4X9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MUC6Q6W4X9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MUC6Q6W4X9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MUC6Q6W4X9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MUC6Q6W4X9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MUC6Q6W4X9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MUC6Q6W4X9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
MUC6Q6W4X9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MUC6Q6W4X9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MUC6Q6W4X9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MUC6Q6W4X9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
MUC6Q6W4X9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MUC6Q6W4X9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MUC6Q6W4X9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MUC6Q6W4X9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MUC6Q6W4X9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MUC6Q6W4X9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MUC6Q6W4X9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MUC6Q6W4X9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MUC6Q6W4X9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MUC6Q6W4X9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MUC6Q6W4X9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MUC6Q6W4X9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MUC6Q6W4X9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MUC6Q6W4X9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MUC6Q6W4X9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MUC6Q6W4X9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MUC6Q6W4X9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MUC6Q6W4X9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
MUC6Q6W4X9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MUC6Q6W4X9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MUC6Q6W4X9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MUC6Q6W4X9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MUC6Q6W4X9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MUC6Q6W4X9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MUC6Q6W4X9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MUC6Q6W4X9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MUC6Q6W4X9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MUC6Q6W4X9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MUC6Q6W4X9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MUC6Q6W4X9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MUC6Q6W4X9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MUC6Q6W4X9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MUC6Q6W4X9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MUC6Q6W4X9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms