Protein–RNA interactions for Protein: Q63HR2

TNS2, Tensin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS2Q63HR2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.89■■■■■ 4.94
TNS2Q63HR2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
TNS2Q63HR2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
TNS2Q63HR2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
TNS2Q63HR2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
TNS2Q63HR2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TNS2Q63HR2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TNS2Q63HR2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
TNS2Q63HR2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
TNS2Q63HR2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
TNS2Q63HR2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TNS2Q63HR2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TNS2Q63HR2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TNS2Q63HR2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNS2Q63HR2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TNS2Q63HR2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
TNS2Q63HR2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TNS2Q63HR2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TNS2Q63HR2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TNS2Q63HR2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TNS2Q63HR2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TNS2Q63HR2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TNS2Q63HR2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TNS2Q63HR2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TNS2Q63HR2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNS2Q63HR2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TNS2Q63HR2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TNS2Q63HR2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TNS2Q63HR2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TNS2Q63HR2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TNS2Q63HR2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
TNS2Q63HR2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TNS2Q63HR2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
TNS2Q63HR2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TNS2Q63HR2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TNS2Q63HR2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNS2Q63HR2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
TNS2Q63HR2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TNS2Q63HR2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TNS2Q63HR2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNS2Q63HR2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TNS2Q63HR2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
TNS2Q63HR2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
TNS2Q63HR2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TNS2Q63HR2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TNS2Q63HR2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNS2Q63HR2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNS2Q63HR2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TNS2Q63HR2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNS2Q63HR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TNS2Q63HR2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TNS2Q63HR2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TNS2Q63HR2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TNS2Q63HR2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TNS2Q63HR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TNS2Q63HR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TNS2Q63HR2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNS2Q63HR2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TNS2Q63HR2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNS2Q63HR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNS2Q63HR2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNS2Q63HR2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TNS2Q63HR2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TNS2Q63HR2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TNS2Q63HR2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNS2Q63HR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TNS2Q63HR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNS2Q63HR2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TNS2Q63HR2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNS2Q63HR2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TNS2Q63HR2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
TNS2Q63HR2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNS2Q63HR2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNS2Q63HR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNS2Q63HR2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNS2Q63HR2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNS2Q63HR2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
TNS2Q63HR2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNS2Q63HR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TNS2Q63HR2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNS2Q63HR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNS2Q63HR2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TNS2Q63HR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TNS2Q63HR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNS2Q63HR2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TNS2Q63HR2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNS2Q63HR2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNS2Q63HR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TNS2Q63HR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TNS2Q63HR2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNS2Q63HR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNS2Q63HR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNS2Q63HR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNS2Q63HR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNS2Q63HR2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms