Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HES3Q5TGS1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HES3Q5TGS1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HES3Q5TGS1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HES3Q5TGS1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HES3Q5TGS1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HES3Q5TGS1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HES3Q5TGS1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HES3Q5TGS1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
HES3Q5TGS1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HES3Q5TGS1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HES3Q5TGS1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HES3Q5TGS1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HES3Q5TGS1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HES3Q5TGS1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HES3Q5TGS1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HES3Q5TGS1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HES3Q5TGS1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HES3Q5TGS1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HES3Q5TGS1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HES3Q5TGS1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HES3Q5TGS1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HES3Q5TGS1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HES3Q5TGS1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HES3Q5TGS1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HES3Q5TGS1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HES3Q5TGS1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HES3Q5TGS1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HES3Q5TGS1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HES3Q5TGS1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HES3Q5TGS1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HES3Q5TGS1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
HES3Q5TGS1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HES3Q5TGS1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HES3Q5TGS1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HES3Q5TGS1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HES3Q5TGS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HES3Q5TGS1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HES3Q5TGS1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HES3Q5TGS1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HES3Q5TGS1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HES3Q5TGS1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HES3Q5TGS1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HES3Q5TGS1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HES3Q5TGS1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HES3Q5TGS1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HES3Q5TGS1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HES3Q5TGS1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HES3Q5TGS1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HES3Q5TGS1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HES3Q5TGS1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HES3Q5TGS1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HES3Q5TGS1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HES3Q5TGS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HES3Q5TGS1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HES3Q5TGS1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HES3Q5TGS1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HES3Q5TGS1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HES3Q5TGS1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HES3Q5TGS1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HES3Q5TGS1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HES3Q5TGS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HES3Q5TGS1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HES3Q5TGS1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HES3Q5TGS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HES3Q5TGS1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HES3Q5TGS1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HES3Q5TGS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HES3Q5TGS1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HES3Q5TGS1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HES3Q5TGS1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HES3Q5TGS1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HES3Q5TGS1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HES3Q5TGS1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HES3Q5TGS1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HES3Q5TGS1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HES3Q5TGS1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HES3Q5TGS1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HES3Q5TGS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HES3Q5TGS1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HES3Q5TGS1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HES3Q5TGS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HES3Q5TGS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HES3Q5TGS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HES3Q5TGS1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HES3Q5TGS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HES3Q5TGS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HES3Q5TGS1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HES3Q5TGS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms