Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP20-2Q3LI61 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP20-2Q3LI61 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP20-2Q3LI61 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP20-2Q3LI61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP20-2Q3LI61 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP20-2Q3LI61 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP20-2Q3LI61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP20-2Q3LI61 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP20-2Q3LI61 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP20-2Q3LI61 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP20-2Q3LI61 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP20-2Q3LI61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP20-2Q3LI61 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP20-2Q3LI61 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP20-2Q3LI61 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP20-2Q3LI61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP20-2Q3LI61 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP20-2Q3LI61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP20-2Q3LI61 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP20-2Q3LI61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP20-2Q3LI61 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP20-2Q3LI61 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP20-2Q3LI61 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP20-2Q3LI61 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-2Q3LI61 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-2Q3LI61 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-2Q3LI61 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-2Q3LI61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-2Q3LI61 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-2Q3LI61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP20-2Q3LI61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP20-2Q3LI61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP20-2Q3LI61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP20-2Q3LI61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP20-2Q3LI61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP20-2Q3LI61 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP20-2Q3LI61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP20-2Q3LI61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms