Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KIF4BQ2VIQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
KIF4BQ2VIQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
KIF4BQ2VIQ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
KIF4BQ2VIQ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KIF4BQ2VIQ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
KIF4BQ2VIQ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIF4BQ2VIQ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
KIF4BQ2VIQ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
KIF4BQ2VIQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KIF4BQ2VIQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KIF4BQ2VIQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
KIF4BQ2VIQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIF4BQ2VIQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
KIF4BQ2VIQ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KIF4BQ2VIQ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KIF4BQ2VIQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KIF4BQ2VIQ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KIF4BQ2VIQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIF4BQ2VIQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIF4BQ2VIQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KIF4BQ2VIQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KIF4BQ2VIQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIF4BQ2VIQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIF4BQ2VIQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
KIF4BQ2VIQ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
KIF4BQ2VIQ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KIF4BQ2VIQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KIF4BQ2VIQ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KIF4BQ2VIQ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KIF4BQ2VIQ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
KIF4BQ2VIQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KIF4BQ2VIQ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KIF4BQ2VIQ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIF4BQ2VIQ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KIF4BQ2VIQ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
KIF4BQ2VIQ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KIF4BQ2VIQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KIF4BQ2VIQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KIF4BQ2VIQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIF4BQ2VIQ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF4BQ2VIQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF4BQ2VIQ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
KIF4BQ2VIQ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
KIF4BQ2VIQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIF4BQ2VIQ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIF4BQ2VIQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KIF4BQ2VIQ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIF4BQ2VIQ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIF4BQ2VIQ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KIF4BQ2VIQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIF4BQ2VIQ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIF4BQ2VIQ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIF4BQ2VIQ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIF4BQ2VIQ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KIF4BQ2VIQ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KIF4BQ2VIQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KIF4BQ2VIQ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KIF4BQ2VIQ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KIF4BQ2VIQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIF4BQ2VIQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIF4BQ2VIQ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIF4BQ2VIQ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KIF4BQ2VIQ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KIF4BQ2VIQ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KIF4BQ2VIQ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIF4BQ2VIQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIF4BQ2VIQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KIF4BQ2VIQ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KIF4BQ2VIQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KIF4BQ2VIQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIF4BQ2VIQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KIF4BQ2VIQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KIF4BQ2VIQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KIF4BQ2VIQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
KIF4BQ2VIQ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KIF4BQ2VIQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KIF4BQ2VIQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms