Protein–RNA interactions for Protein: Q16609

LPAL2, Putative apolipoprotein(a)-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAL2Q16609 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LPAL2Q16609 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LPAL2Q16609 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LPAL2Q16609 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LPAL2Q16609 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LPAL2Q16609 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LPAL2Q16609 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LPAL2Q16609 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LPAL2Q16609 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LPAL2Q16609 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LPAL2Q16609 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LPAL2Q16609 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LPAL2Q16609 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LPAL2Q16609 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LPAL2Q16609 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LPAL2Q16609 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LPAL2Q16609 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LPAL2Q16609 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LPAL2Q16609 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LPAL2Q16609 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LPAL2Q16609 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LPAL2Q16609 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LPAL2Q16609 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LPAL2Q16609 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LPAL2Q16609 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LPAL2Q16609 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LPAL2Q16609 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LPAL2Q16609 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LPAL2Q16609 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LPAL2Q16609 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LPAL2Q16609 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LPAL2Q16609 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LPAL2Q16609 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LPAL2Q16609 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LPAL2Q16609 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LPAL2Q16609 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LPAL2Q16609 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LPAL2Q16609 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LPAL2Q16609 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LPAL2Q16609 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LPAL2Q16609 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LPAL2Q16609 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LPAL2Q16609 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LPAL2Q16609 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LPAL2Q16609 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LPAL2Q16609 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LPAL2Q16609 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LPAL2Q16609 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LPAL2Q16609 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LPAL2Q16609 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LPAL2Q16609 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LPAL2Q16609 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LPAL2Q16609 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LPAL2Q16609 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LPAL2Q16609 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LPAL2Q16609 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LPAL2Q16609 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LPAL2Q16609 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LPAL2Q16609 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LPAL2Q16609 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LPAL2Q16609 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LPAL2Q16609 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LPAL2Q16609 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LPAL2Q16609 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LPAL2Q16609 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LPAL2Q16609 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LPAL2Q16609 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LPAL2Q16609 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LPAL2Q16609 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LPAL2Q16609 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LPAL2Q16609 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LPAL2Q16609 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LPAL2Q16609 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LPAL2Q16609 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LPAL2Q16609 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LPAL2Q16609 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LPAL2Q16609 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LPAL2Q16609 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LPAL2Q16609 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LPAL2Q16609 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LPAL2Q16609 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LPAL2Q16609 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LPAL2Q16609 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LPAL2Q16609 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LPAL2Q16609 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAL2Q16609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPAL2Q16609 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms