Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.99■■■■■ 4.95
DDB1Q16531 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
DDB1Q16531 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
DDB1Q16531 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
DDB1Q16531 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DDB1Q16531 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
DDB1Q16531 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
DDB1Q16531 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
DDB1Q16531 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
DDB1Q16531 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
DDB1Q16531 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
DDB1Q16531 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
DDB1Q16531 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
DDB1Q16531 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
DDB1Q16531 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
DDB1Q16531 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
DDB1Q16531 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
DDB1Q16531 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
DDB1Q16531 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
DDB1Q16531 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
DDB1Q16531 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
DDB1Q16531 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DDB1Q16531 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DDB1Q16531 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
DDB1Q16531 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
DDB1Q16531 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DDB1Q16531 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
DDB1Q16531 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
DDB1Q16531 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
DDB1Q16531 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
DDB1Q16531 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
DDB1Q16531 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
DDB1Q16531 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
DDB1Q16531 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
DDB1Q16531 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DDB1Q16531 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
DDB1Q16531 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
DDB1Q16531 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DDB1Q16531 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DDB1Q16531 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
DDB1Q16531 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
DDB1Q16531 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
DDB1Q16531 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DDB1Q16531 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
DDB1Q16531 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
DDB1Q16531 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
DDB1Q16531 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
DDB1Q16531 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
DDB1Q16531 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
DDB1Q16531 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
DDB1Q16531 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DDB1Q16531 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
DDB1Q16531 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
DDB1Q16531 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DDB1Q16531 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
DDB1Q16531 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
DDB1Q16531 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
DDB1Q16531 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
DDB1Q16531 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
DDB1Q16531 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DDB1Q16531 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DDB1Q16531 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DDB1Q16531 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DDB1Q16531 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
DDB1Q16531 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
DDB1Q16531 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
DDB1Q16531 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
DDB1Q16531 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
DDB1Q16531 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
DDB1Q16531 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
DDB1Q16531 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
DDB1Q16531 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
DDB1Q16531 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
DDB1Q16531 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
DDB1Q16531 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
DDB1Q16531 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
DDB1Q16531 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
DDB1Q16531 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
DDB1Q16531 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
DDB1Q16531 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
DDB1Q16531 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
DDB1Q16531 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
DDB1Q16531 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
DDB1Q16531 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
DDB1Q16531 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
DDB1Q16531 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
DDB1Q16531 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
DDB1Q16531 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
DDB1Q16531 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
DDB1Q16531 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
DDB1Q16531 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
DDB1Q16531 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
DDB1Q16531 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
DDB1Q16531 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
DDB1Q16531 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
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