Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TAF1CQ15572 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TAF1CQ15572 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TAF1CQ15572 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TAF1CQ15572 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TAF1CQ15572 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TAF1CQ15572 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TAF1CQ15572 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TAF1CQ15572 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TAF1CQ15572 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TAF1CQ15572 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TAF1CQ15572 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
TAF1CQ15572 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TAF1CQ15572 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TAF1CQ15572 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TAF1CQ15572 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TAF1CQ15572 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TAF1CQ15572 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TAF1CQ15572 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TAF1CQ15572 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TAF1CQ15572 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TAF1CQ15572 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TAF1CQ15572 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TAF1CQ15572 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TAF1CQ15572 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TAF1CQ15572 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TAF1CQ15572 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TAF1CQ15572 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TAF1CQ15572 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TAF1CQ15572 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TAF1CQ15572 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TAF1CQ15572 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TAF1CQ15572 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TAF1CQ15572 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TAF1CQ15572 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TAF1CQ15572 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TAF1CQ15572 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TAF1CQ15572 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TAF1CQ15572 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TAF1CQ15572 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TAF1CQ15572 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TAF1CQ15572 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TAF1CQ15572 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TAF1CQ15572 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TAF1CQ15572 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TAF1CQ15572 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TAF1CQ15572 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TAF1CQ15572 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TAF1CQ15572 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TAF1CQ15572 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TAF1CQ15572 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TAF1CQ15572 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TAF1CQ15572 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TAF1CQ15572 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TAF1CQ15572 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TAF1CQ15572 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TAF1CQ15572 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TAF1CQ15572 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TAF1CQ15572 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TAF1CQ15572 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TAF1CQ15572 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TAF1CQ15572 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TAF1CQ15572 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TAF1CQ15572 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TAF1CQ15572 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TAF1CQ15572 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TAF1CQ15572 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1CQ15572 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1CQ15572 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TAF1CQ15572 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TAF1CQ15572 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TAF1CQ15572 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TAF1CQ15572 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TAF1CQ15572 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1CQ15572 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TAF1CQ15572 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TAF1CQ15572 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TAF1CQ15572 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TAF1CQ15572 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TAF1CQ15572 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TAF1CQ15572 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TAF1CQ15572 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TAF1CQ15572 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TAF1CQ15572 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TAF1CQ15572 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TAF1CQ15572 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TAF1CQ15572 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TAF1CQ15572 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1CQ15572 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1CQ15572 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1CQ15572 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TAF1CQ15572 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TAF1CQ15572 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TAF1CQ15572 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
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