Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.12■■■■■ 6.89
GAPVD1Q14C86 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.02■■■■■ 6.88
GAPVD1Q14C86 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.27■■■■■ 6.76
GAPVD1Q14C86 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.81■■■■■ 6.68
GAPVD1Q14C86 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.19■■■■■ 6.59
GAPVD1Q14C86 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.71■■■■■ 6.51
GAPVD1Q14C86 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.44■■■■■ 6.47
GAPVD1Q14C86 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.28■■■■■ 6.44
GAPVD1Q14C86 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
GAPVD1Q14C86 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
GAPVD1Q14C86 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC55.16■■■■■ 6.42
GAPVD1Q14C86 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
GAPVD1Q14C86 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC54.98■■■■■ 6.39
GAPVD1Q14C86 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.93■■■■■ 6.38
GAPVD1Q14C86 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.69■■■■■ 6.35
GAPVD1Q14C86 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
GAPVD1Q14C86 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.17■■■■■ 6.26
GAPVD1Q14C86 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
GAPVD1Q14C86 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.22
GAPVD1Q14C86 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
GAPVD1Q14C86 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
GAPVD1Q14C86 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
GAPVD1Q14C86 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.54■■■■■ 6.16
GAPVD1Q14C86 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
GAPVD1Q14C86 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.45■■■■■ 6.15
GAPVD1Q14C86 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.35■■■■■ 6.13
GAPVD1Q14C86 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
GAPVD1Q14C86 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.24■■■■■ 6.11
GAPVD1Q14C86 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.98■■■■■ 6.07
GAPVD1Q14C86 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.96■■■■■ 6.07
GAPVD1Q14C86 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.94■■■■■ 6.06
GAPVD1Q14C86 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.85■■■■■ 6.05
GAPVD1Q14C86 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
GAPVD1Q14C86 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.55■■■■■ 6
GAPVD1Q14C86 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.43■■■■■ 5.98
GAPVD1Q14C86 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
GAPVD1Q14C86 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
GAPVD1Q14C86 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.3■■■■■ 5.96
GAPVD1Q14C86 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
GAPVD1Q14C86 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
GAPVD1Q14C86 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
GAPVD1Q14C86 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.7■■■■■ 5.87
GAPVD1Q14C86 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
GAPVD1Q14C86 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
GAPVD1Q14C86 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
GAPVD1Q14C86 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.31■■■■■ 5.8
GAPVD1Q14C86 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
GAPVD1Q14C86 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
GAPVD1Q14C86 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
GAPVD1Q14C86 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
GAPVD1Q14C86 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.11■■■■■ 5.77
GAPVD1Q14C86 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
GAPVD1Q14C86 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.1■■■■■ 5.77
GAPVD1Q14C86 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
GAPVD1Q14C86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
GAPVD1Q14C86 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.04■■■■■ 5.76
GAPVD1Q14C86 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
GAPVD1Q14C86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
GAPVD1Q14C86 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
GAPVD1Q14C86 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
GAPVD1Q14C86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.7■■■■■ 5.71
GAPVD1Q14C86 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
GAPVD1Q14C86 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
GAPVD1Q14C86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
GAPVD1Q14C86 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
GAPVD1Q14C86 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
GAPVD1Q14C86 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
GAPVD1Q14C86 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
GAPVD1Q14C86 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
GAPVD1Q14C86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
GAPVD1Q14C86 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
GAPVD1Q14C86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.33■■■■■ 5.65
GAPVD1Q14C86 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.32■■■■■ 5.65
GAPVD1Q14C86 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
GAPVD1Q14C86 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
GAPVD1Q14C86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
GAPVD1Q14C86 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
GAPVD1Q14C86 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.26■■■■■ 5.64
GAPVD1Q14C86 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
GAPVD1Q14C86 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
GAPVD1Q14C86 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.12■■■■■ 5.61
GAPVD1Q14C86 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
GAPVD1Q14C86 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
GAPVD1Q14C86 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
GAPVD1Q14C86 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.97■■■■■ 5.59
GAPVD1Q14C86 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
GAPVD1Q14C86 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.95■■■■■ 5.59
GAPVD1Q14C86 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.93■■■■■ 5.58
GAPVD1Q14C86 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.88■■■■■ 5.57
GAPVD1Q14C86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
GAPVD1Q14C86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
GAPVD1Q14C86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
GAPVD1Q14C86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
GAPVD1Q14C86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
GAPVD1Q14C86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
GAPVD1Q14C86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
GAPVD1Q14C86 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
GAPVD1Q14C86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
GAPVD1Q14C86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
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