Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.46■■■■■ 5.51
NWD1Q149M9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NWD1Q149M9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.84■■■■■ 5.41
NWD1Q149M9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
NWD1Q149M9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NWD1Q149M9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
NWD1Q149M9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NWD1Q149M9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NWD1Q149M9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
NWD1Q149M9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
NWD1Q149M9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
NWD1Q149M9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NWD1Q149M9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
NWD1Q149M9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
NWD1Q149M9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
NWD1Q149M9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
NWD1Q149M9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
NWD1Q149M9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NWD1Q149M9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NWD1Q149M9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NWD1Q149M9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NWD1Q149M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NWD1Q149M9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
NWD1Q149M9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NWD1Q149M9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NWD1Q149M9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NWD1Q149M9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NWD1Q149M9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
NWD1Q149M9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NWD1Q149M9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
NWD1Q149M9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
NWD1Q149M9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NWD1Q149M9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NWD1Q149M9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
NWD1Q149M9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
NWD1Q149M9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
NWD1Q149M9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NWD1Q149M9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
NWD1Q149M9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
NWD1Q149M9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NWD1Q149M9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NWD1Q149M9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
NWD1Q149M9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
NWD1Q149M9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NWD1Q149M9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
NWD1Q149M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NWD1Q149M9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
NWD1Q149M9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
NWD1Q149M9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NWD1Q149M9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NWD1Q149M9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NWD1Q149M9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NWD1Q149M9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
NWD1Q149M9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NWD1Q149M9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NWD1Q149M9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NWD1Q149M9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
NWD1Q149M9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NWD1Q149M9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NWD1Q149M9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
NWD1Q149M9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NWD1Q149M9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NWD1Q149M9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
NWD1Q149M9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NWD1Q149M9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NWD1Q149M9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NWD1Q149M9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NWD1Q149M9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NWD1Q149M9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NWD1Q149M9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NWD1Q149M9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NWD1Q149M9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NWD1Q149M9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
NWD1Q149M9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NWD1Q149M9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NWD1Q149M9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
NWD1Q149M9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NWD1Q149M9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
NWD1Q149M9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NWD1Q149M9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NWD1Q149M9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
NWD1Q149M9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NWD1Q149M9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NWD1Q149M9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NWD1Q149M9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NWD1Q149M9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
NWD1Q149M9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NWD1Q149M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NWD1Q149M9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NWD1Q149M9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NWD1Q149M9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
NWD1Q149M9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NWD1Q149M9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NWD1Q149M9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
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