Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GPM6BQ13491 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GPM6BQ13491 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GPM6BQ13491 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GPM6BQ13491 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GPM6BQ13491 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GPM6BQ13491 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GPM6BQ13491 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GPM6BQ13491 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GPM6BQ13491 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GPM6BQ13491 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GPM6BQ13491 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GPM6BQ13491 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GPM6BQ13491 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GPM6BQ13491 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GPM6BQ13491 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GPM6BQ13491 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GPM6BQ13491 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GPM6BQ13491 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GPM6BQ13491 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GPM6BQ13491 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GPM6BQ13491 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GPM6BQ13491 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GPM6BQ13491 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GPM6BQ13491 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GPM6BQ13491 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GPM6BQ13491 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GPM6BQ13491 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GPM6BQ13491 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GPM6BQ13491 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GPM6BQ13491 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
GPM6BQ13491 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GPM6BQ13491 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GPM6BQ13491 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPM6BQ13491 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GPM6BQ13491 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GPM6BQ13491 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GPM6BQ13491 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GPM6BQ13491 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GPM6BQ13491 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GPM6BQ13491 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GPM6BQ13491 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GPM6BQ13491 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GPM6BQ13491 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GPM6BQ13491 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GPM6BQ13491 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GPM6BQ13491 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GPM6BQ13491 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPM6BQ13491 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GPM6BQ13491 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GPM6BQ13491 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GPM6BQ13491 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GPM6BQ13491 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GPM6BQ13491 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GPM6BQ13491 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GPM6BQ13491 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GPM6BQ13491 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GPM6BQ13491 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPM6BQ13491 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPM6BQ13491 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GPM6BQ13491 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPM6BQ13491 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPM6BQ13491 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GPM6BQ13491 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GPM6BQ13491 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GPM6BQ13491 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GPM6BQ13491 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GPM6BQ13491 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPM6BQ13491 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPM6BQ13491 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPM6BQ13491 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GPM6BQ13491 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GPM6BQ13491 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GPM6BQ13491 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GPM6BQ13491 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPM6BQ13491 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPM6BQ13491 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GPM6BQ13491 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GPM6BQ13491 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GPM6BQ13491 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GPM6BQ13491 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GPM6BQ13491 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPM6BQ13491 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPM6BQ13491 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPM6BQ13491 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPM6BQ13491 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPM6BQ13491 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GPM6BQ13491 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPM6BQ13491 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GPM6BQ13491 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
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