Protein–RNA interactions for Protein: Q13427

PPIG, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIGQ13427 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.262e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.5□□□□□ -0.732e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.11□□□□□ -1.752e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.01□□□□□ -1.772e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 53.76□□□□□ -1.812e-27■■■■■ 81.9
PPIGQ13427 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.162e-27■■■■■ 81.9
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PPIGQ13427 POLE-218ENST00000542362 508 ntTSL 410.27□□□□□ -0.772e-14■■■■■ 62.3
PPIGQ13427 ACSF3-205ENST00000535176 421 ntTSL 311.71□□□□□ -0.535e-15■■■■■ 58.2
PPIGQ13427 ANO9-203ENST00000525804 260 ntTSL 211.01□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 57.8
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PPIGQ13427 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 57.4
PPIGQ13427 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 57.4
PPIGQ13427 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 57.4
PPIGQ13427 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 57.4
PPIGQ13427 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 57.4
PPIGQ13427 FER1L4-202ENST00000412452 723 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-14■■■■■ 55.3
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PPIGQ13427 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-14■■■■■ 55.3
PPIGQ13427 KRBA1-202ENST00000467333 699 ntTSL 213.15□□□□□ -0.33e-14■■■■■ 55.3
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PPIGQ13427 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 53.9
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PPIGQ13427 HSF4-218ENST00000522023 636 ntTSL 421.79■■□□□ 1.086e-14■■■■■ 53.9
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PPIGQ13427 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.39■□□□□ 0.376e-14■■■■■ 53.9
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PPIGQ13427 RALGPS1-210ENST00000467325 330 ntTSL 58.53□□□□□ -1.044e-12■■■■■ 46.8
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PPIGQ13427 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-9■■■■■ 46.1
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PPIGQ13427 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.671e-17■■■■■ 43.6
PPIGQ13427 COL16A1-215ENST00000488897 2423 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.666e-9■■■■■ 43.5
PPIGQ13427 CYC1-202ENST00000525122 543 ntTSL 215.43■□□□□ 0.067e-17■■■■■ 43.4
PPIGQ13427 ARHGAP45-204ENST00000586033 545 ntTSL 523.24■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 43.3
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PPIGQ13427 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.317e-12■■■■■ 43.3
PPIGQ13427 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.437e-12■■■■■ 43.3
PPIGQ13427 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.467e-12■■■■■ 43.3
PPIGQ13427 SPG11-204ENST00000557866 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.57□□□□□ -1.27e-12■■■■■ 43.3
PPIGQ13427 ATP13A3-207ENST00000484023 522 ntTSL 24.78□□□□□ -1.647e-12■■■■■ 43.3
PPIGQ13427 KCTD3-202ENST00000448333 751 ntTSL 211.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 43
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PPIGQ13427 PI4KAP2-206ENST00000470274 2414 ntTSL 216.96■□□□□ 0.34e-12■■■■■ 42.9
PPIGQ13427 GCKR-204ENST00000453813 701 ntTSL 316.36■□□□□ 0.218e-8■■■■■ 42.7
PPIGQ13427 ACADVL-235ENST00000583848 503 ntTSL 314.9□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 42.5
PPIGQ13427 VPS13A-210ENST00000471439 510 ntTSL 34.8□□□□□ -1.641e-9■■■■■ 42.5
PPIGQ13427 BET1L-205ENST00000479463 684 ntTSL 324.38■■□□□ 1.499e-13■■■■■ 42.4
PPIGQ13427 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.379e-13■■■■■ 42.4
PPIGQ13427 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.339e-13■■■■■ 42.4
PPIGQ13427 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.029e-13■■■■■ 42.4
Retrieved 100 of 47,883 protein–RNA pairs in 1319.4 ms