Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCGB2A2Q13296 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCGB2A2Q13296 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCGB2A2Q13296 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCGB2A2Q13296 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCGB2A2Q13296 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCGB2A2Q13296 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCGB2A2Q13296 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCGB2A2Q13296 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCGB2A2Q13296 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCGB2A2Q13296 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCGB2A2Q13296 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCGB2A2Q13296 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCGB2A2Q13296 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCGB2A2Q13296 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCGB2A2Q13296 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCGB2A2Q13296 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCGB2A2Q13296 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCGB2A2Q13296 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCGB2A2Q13296 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCGB2A2Q13296 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCGB2A2Q13296 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCGB2A2Q13296 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCGB2A2Q13296 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCGB2A2Q13296 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCGB2A2Q13296 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCGB2A2Q13296 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCGB2A2Q13296 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCGB2A2Q13296 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCGB2A2Q13296 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCGB2A2Q13296 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCGB2A2Q13296 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCGB2A2Q13296 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCGB2A2Q13296 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCGB2A2Q13296 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCGB2A2Q13296 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCGB2A2Q13296 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCGB2A2Q13296 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCGB2A2Q13296 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCGB2A2Q13296 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCGB2A2Q13296 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCGB2A2Q13296 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCGB2A2Q13296 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCGB2A2Q13296 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCGB2A2Q13296 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCGB2A2Q13296 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCGB2A2Q13296 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCGB2A2Q13296 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCGB2A2Q13296 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCGB2A2Q13296 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCGB2A2Q13296 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCGB2A2Q13296 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCGB2A2Q13296 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCGB2A2Q13296 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCGB2A2Q13296 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCGB2A2Q13296 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCGB2A2Q13296 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCGB2A2Q13296 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCGB2A2Q13296 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCGB2A2Q13296 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCGB2A2Q13296 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCGB2A2Q13296 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCGB2A2Q13296 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCGB2A2Q13296 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCGB2A2Q13296 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCGB2A2Q13296 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCGB2A2Q13296 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCGB2A2Q13296 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCGB2A2Q13296 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCGB2A2Q13296 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCGB2A2Q13296 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCGB2A2Q13296 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCGB2A2Q13296 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCGB2A2Q13296 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCGB2A2Q13296 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCGB2A2Q13296 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCGB2A2Q13296 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCGB2A2Q13296 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCGB2A2Q13296 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCGB2A2Q13296 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCGB2A2Q13296 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCGB2A2Q13296 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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