Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM32Q13049 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM32Q13049 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM32Q13049 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRIM32Q13049 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM32Q13049 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRIM32Q13049 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM32Q13049 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRIM32Q13049 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TRIM32Q13049 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM32Q13049 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM32Q13049 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM32Q13049 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRIM32Q13049 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRIM32Q13049 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM32Q13049 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM32Q13049 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM32Q13049 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM32Q13049 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM32Q13049 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM32Q13049 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRIM32Q13049 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRIM32Q13049 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TRIM32Q13049 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM32Q13049 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM32Q13049 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM32Q13049 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM32Q13049 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM32Q13049 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM32Q13049 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM32Q13049 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM32Q13049 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM32Q13049 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM32Q13049 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM32Q13049 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM32Q13049 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRIM32Q13049 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TRIM32Q13049 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM32Q13049 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM32Q13049 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM32Q13049 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM32Q13049 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM32Q13049 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM32Q13049 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM32Q13049 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM32Q13049 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM32Q13049 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM32Q13049 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM32Q13049 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM32Q13049 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM32Q13049 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM32Q13049 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM32Q13049 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM32Q13049 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM32Q13049 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM32Q13049 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM32Q13049 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRIM32Q13049 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRIM32Q13049 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM32Q13049 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM32Q13049 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM32Q13049 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM32Q13049 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM32Q13049 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM32Q13049 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM32Q13049 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM32Q13049 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM32Q13049 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM32Q13049 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM32Q13049 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM32Q13049 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM32Q13049 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM32Q13049 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM32Q13049 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM32Q13049 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRIM32Q13049 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM32Q13049 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM32Q13049 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM32Q13049 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM32Q13049 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM32Q13049 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM32Q13049 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM32Q13049 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM32Q13049 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM32Q13049 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM32Q13049 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM32Q13049 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM32Q13049 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM32Q13049 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM32Q13049 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM32Q13049 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM32Q13049 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM32Q13049 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM32Q13049 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM32Q13049 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM32Q13049 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms