Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC60.28■■■■■ 7.24
PRDM2Q13029 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC60.18■■■■■ 7.22
PRDM2Q13029 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC59.48■■■■■ 7.11
PRDM2Q13029 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.98■■■■■ 7.03
PRDM2Q13029 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.39■■■■■ 6.94
PRDM2Q13029 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.94■■■■■ 6.87
PRDM2Q13029 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC57.52■■■■■ 6.8
PRDM2Q13029 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.5■■■■■ 6.79
PRDM2Q13029 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.49■■■■■ 6.79
PRDM2Q13029 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.41■■■■■ 6.78
PRDM2Q13029 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC57.36■■■■■ 6.77
PRDM2Q13029 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC57.28■■■■■ 6.76
PRDM2Q13029 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC57.11■■■■■ 6.73
PRDM2Q13029 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC57.05■■■■■ 6.72
PRDM2Q13029 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.77■■■■■ 6.68
PRDM2Q13029 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
PRDM2Q13029 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.52■■■■■ 6.64
PRDM2Q13029 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC56.24■■■■■ 6.59
PRDM2Q13029 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.24■■■■■ 6.59
PRDM2Q13029 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.85■■■■■ 6.53
PRDM2Q13029 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
PRDM2Q13029 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
PRDM2Q13029 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
PRDM2Q13029 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
PRDM2Q13029 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC55.46■■■■■ 6.47
PRDM2Q13029 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.34■■■■■ 6.45
PRDM2Q13029 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.32■■■■■ 6.45
PRDM2Q13029 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.19■■■■■ 6.43
PRDM2Q13029 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.09■■■■■ 6.41
PRDM2Q13029 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC55.03■■■■■ 6.4
PRDM2Q13029 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC55.01■■■■■ 6.4
PRDM2Q13029 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC54.95■■■■■ 6.39
PRDM2Q13029 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC54.91■■■■■ 6.38
PRDM2Q13029 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.68■■■■■ 6.34
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC54.6■■■■■ 6.33
PRDM2Q13029 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.48■■■■■ 6.31
PRDM2Q13029 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC54.35■■■■■ 6.29
PRDM2Q13029 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
PRDM2Q13029 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
PRDM2Q13029 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
PRDM2Q13029 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC53.89■■■■■ 6.22
PRDM2Q13029 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC53.83■■■■■ 6.21
PRDM2Q13029 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
PRDM2Q13029 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
PRDM2Q13029 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
PRDM2Q13029 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
PRDM2Q13029 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
PRDM2Q13029 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
PRDM2Q13029 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC53.15■■■■■ 6.1
PRDM2Q13029 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
PRDM2Q13029 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC53.06■■■■■ 6.08
PRDM2Q13029 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.03■■■■■ 6.08
PRDM2Q13029 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC53.01■■■■■ 6.08
PRDM2Q13029 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.97■■■■■ 6.07
PRDM2Q13029 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
PRDM2Q13029 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
PRDM2Q13029 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
PRDM2Q13029 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
PRDM2Q13029 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC52.8■■■■■ 6.04
PRDM2Q13029 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC52.77■■■■■ 6.04
PRDM2Q13029 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
PRDM2Q13029 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
PRDM2Q13029 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
PRDM2Q13029 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.65■■■■■ 6.02
PRDM2Q13029 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
PRDM2Q13029 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
PRDM2Q13029 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC52.51■■■■■ 6
PRDM2Q13029 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
PRDM2Q13029 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
PRDM2Q13029 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
PRDM2Q13029 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
PRDM2Q13029 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
PRDM2Q13029 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
PRDM2Q13029 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
PRDM2Q13029 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.15■■■■■ 5.94
PRDM2Q13029 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
PRDM2Q13029 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
PRDM2Q13029 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC52.08■■■■■ 5.93
PRDM2Q13029 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.06■■■■■ 5.93
PRDM2Q13029 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC52.02■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
PRDM2Q13029 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
PRDM2Q13029 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC51.91■■■■■ 5.9
PRDM2Q13029 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC51.82■■■■■ 5.89
PRDM2Q13029 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
PRDM2Q13029 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
PRDM2Q13029 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
PRDM2Q13029 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
PRDM2Q13029 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
PRDM2Q13029 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
PRDM2Q13029 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
PRDM2Q13029 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC51.63■■■■■ 5.86
PRDM2Q13029 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.58■■■■■ 5.85
PRDM2Q13029 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC51.53■■■■■ 5.84
PRDM2Q13029 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC51.5■■■■■ 5.83
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