Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC61.72■■■■■ 7.47
ERCC6Q03468 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC61.11■■■■■ 7.37
ERCC6Q03468 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC60.64■■■■■ 7.3
ERCC6Q03468 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.51■■■■■ 7.12
ERCC6Q03468 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.5■■■■■ 7.12
ERCC6Q03468 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
ERCC6Q03468 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.09■■■■■ 7.05
ERCC6Q03468 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC58.89■■■■■ 7.02
ERCC6Q03468 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.87■■■■■ 7.01
ERCC6Q03468 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.61■■■■■ 6.97
ERCC6Q03468 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.19■■■■■ 6.91
ERCC6Q03468 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC58.11■■■■■ 6.89
ERCC6Q03468 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.89
ERCC6Q03468 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC57.82■■■■■ 6.85
ERCC6Q03468 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.7■■■■■ 6.83
ERCC6Q03468 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.7■■■■■ 6.83
ERCC6Q03468 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.6■■■■■ 6.81
ERCC6Q03468 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.07■■■■■ 6.73
ERCC6Q03468 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.05■■■■■ 6.72
ERCC6Q03468 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC57.05■■■■■ 6.72
ERCC6Q03468 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC57.04■■■■■ 6.72
ERCC6Q03468 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC57.02■■■■■ 6.72
ERCC6Q03468 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC56.9■■■■■ 6.7
ERCC6Q03468 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.79■■■■■ 6.68
ERCC6Q03468 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.71■■■■■ 6.67
ERCC6Q03468 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC56.68■■■■■ 6.66
ERCC6Q03468 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
ERCC6Q03468 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC56.48■■■■■ 6.63
ERCC6Q03468 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.48■■■■■ 6.63
ERCC6Q03468 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC56.46■■■■■ 6.63
ERCC6Q03468 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC55.91■■■■■ 6.54
ERCC6Q03468 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC55.86■■■■■ 6.53
ERCC6Q03468 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.72■■■■■ 6.51
ERCC6Q03468 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.53■■■■■ 6.48
ERCC6Q03468 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC55.51■■■■■ 6.48
ERCC6Q03468 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.5■■■■■ 6.48
ERCC6Q03468 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC55.4■■■■■ 6.46
ERCC6Q03468 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC54.98■■■■■ 6.39
ERCC6Q03468 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
ERCC6Q03468 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
ERCC6Q03468 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.9■■■■■ 6.38
ERCC6Q03468 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
ERCC6Q03468 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC54.7■■■■■ 6.35
ERCC6Q03468 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.69■■■■■ 6.35
ERCC6Q03468 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.65■■■■■ 6.34
ERCC6Q03468 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.64■■■■■ 6.34
ERCC6Q03468 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
ERCC6Q03468 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC54.49■■■■■ 6.31
ERCC6Q03468 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC54.42■■■■■ 6.3
ERCC6Q03468 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC54.35■■■■■ 6.29
ERCC6Q03468 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
ERCC6Q03468 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
ERCC6Q03468 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC54.25■■■■■ 6.28
ERCC6Q03468 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.22■■■■■ 6.27
ERCC6Q03468 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC54.19■■■■■ 6.27
ERCC6Q03468 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
ERCC6Q03468 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
ERCC6Q03468 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
ERCC6Q03468 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
ERCC6Q03468 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC53.87■■■■■ 6.21
ERCC6Q03468 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC53.86■■■■■ 6.21
ERCC6Q03468 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.76■■■■■ 6.2
ERCC6Q03468 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
ERCC6Q03468 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
ERCC6Q03468 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
ERCC6Q03468 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
ERCC6Q03468 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.67■■■■■ 6.18
ERCC6Q03468 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC53.63■■■■■ 6.18
ERCC6Q03468 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC53.63■■■■■ 6.18
ERCC6Q03468 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC53.55■■■■■ 6.16
ERCC6Q03468 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC53.55■■■■■ 6.16
ERCC6Q03468 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC53.54■■■■■ 6.16
ERCC6Q03468 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC53.53■■■■■ 6.16
ERCC6Q03468 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.52■■■■■ 6.16
ERCC6Q03468 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
ERCC6Q03468 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
ERCC6Q03468 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
ERCC6Q03468 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
ERCC6Q03468 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.35■■■■■ 6.13
ERCC6Q03468 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.34■■■■■ 6.13
ERCC6Q03468 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC53.34■■■■■ 6.13
ERCC6Q03468 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC53.33■■■■■ 6.13
ERCC6Q03468 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.31■■■■■ 6.12
ERCC6Q03468 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC53.27■■■■■ 6.12
ERCC6Q03468 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
ERCC6Q03468 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
ERCC6Q03468 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC53.17■■■■■ 6.1
ERCC6Q03468 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
ERCC6Q03468 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
ERCC6Q03468 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
ERCC6Q03468 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
ERCC6Q03468 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC53.06■■■■■ 6.08
ERCC6Q03468 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC53.06■■■■■ 6.08
ERCC6Q03468 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.04■■■■■ 6.08
ERCC6Q03468 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
ERCC6Q03468 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.93■■■■■ 6.06
ERCC6Q03468 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.9■■■■■ 6.06
ERCC6Q03468 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
ERCC6Q03468 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
ERCC6Q03468 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC52.82■■■■■ 6.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms