Protein–RNA interactions for Protein: Q02817

MUC2, Mucin-2, humanhuman

Predictions only

Length 5,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC2Q02817 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MUC2Q02817 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MUC2Q02817 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MUC2Q02817 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC2Q02817 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MUC2Q02817 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MUC2Q02817 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MUC2Q02817 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC2Q02817 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC2Q02817 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC2Q02817 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC2Q02817 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MUC2Q02817 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MUC2Q02817 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MUC2Q02817 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MUC2Q02817 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MUC2Q02817 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MUC2Q02817 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MUC2Q02817 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MUC2Q02817 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MUC2Q02817 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC2Q02817 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MUC2Q02817 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MUC2Q02817 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MUC2Q02817 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUC2Q02817 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUC2Q02817 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MUC2Q02817 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MUC2Q02817 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MUC2Q02817 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MUC2Q02817 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MUC2Q02817 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MUC2Q02817 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MUC2Q02817 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MUC2Q02817 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MUC2Q02817 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MUC2Q02817 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MUC2Q02817 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC2Q02817 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC2Q02817 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MUC2Q02817 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MUC2Q02817 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MUC2Q02817 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MUC2Q02817 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MUC2Q02817 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MUC2Q02817 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MUC2Q02817 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MUC2Q02817 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MUC2Q02817 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MUC2Q02817 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC2Q02817 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC2Q02817 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC2Q02817 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC2Q02817 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC2Q02817 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MUC2Q02817 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MUC2Q02817 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MUC2Q02817 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MUC2Q02817 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MUC2Q02817 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MUC2Q02817 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MUC2Q02817 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MUC2Q02817 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms