Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRSF2Q01130 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRSF2Q01130 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRSF2Q01130 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRSF2Q01130 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRSF2Q01130 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRSF2Q01130 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRSF2Q01130 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRSF2Q01130 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF2Q01130 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRSF2Q01130 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF2Q01130 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF2Q01130 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRSF2Q01130 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF2Q01130 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF2Q01130 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF2Q01130 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRSF2Q01130 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRSF2Q01130 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRSF2Q01130 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRSF2Q01130 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRSF2Q01130 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRSF2Q01130 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRSF2Q01130 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRSF2Q01130 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRSF2Q01130 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRSF2Q01130 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF2Q01130 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRSF2Q01130 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF2Q01130 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF2Q01130 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF2Q01130 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF2Q01130 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF2Q01130 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF2Q01130 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF2Q01130 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF2Q01130 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF2Q01130 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF2Q01130 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRSF2Q01130 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF2Q01130 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF2Q01130 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF2Q01130 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF2Q01130 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF2Q01130 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF2Q01130 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF2Q01130 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF2Q01130 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF2Q01130 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF2Q01130 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF2Q01130 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF2Q01130 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF2Q01130 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF2Q01130 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF2Q01130 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF2Q01130 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF2Q01130 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF2Q01130 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF2Q01130 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF2Q01130 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF2Q01130 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF2Q01130 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF2Q01130 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF2Q01130 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF2Q01130 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF2Q01130 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF2Q01130 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF2Q01130 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF2Q01130 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF2Q01130 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF2Q01130 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF2Q01130 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF2Q01130 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF2Q01130 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF2Q01130 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF2Q01130 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF2Q01130 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF2Q01130 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF2Q01130 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF2Q01130 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF2Q01130 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF2Q01130 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF2Q01130 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF2Q01130 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF2Q01130 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF2Q01130 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF2Q01130 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF2Q01130 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF2Q01130 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF2Q01130 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF2Q01130 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms