Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
APLP1P51693 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
APLP1P51693 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
APLP1P51693 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
APLP1P51693 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
APLP1P51693 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
APLP1P51693 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
APLP1P51693 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
APLP1P51693 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
APLP1P51693 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
APLP1P51693 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
APLP1P51693 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
APLP1P51693 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
APLP1P51693 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
APLP1P51693 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
APLP1P51693 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
APLP1P51693 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
APLP1P51693 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
APLP1P51693 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
APLP1P51693 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
APLP1P51693 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
APLP1P51693 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
APLP1P51693 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
APLP1P51693 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
APLP1P51693 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
APLP1P51693 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
APLP1P51693 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
APLP1P51693 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
APLP1P51693 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
APLP1P51693 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
APLP1P51693 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
APLP1P51693 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
APLP1P51693 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
APLP1P51693 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
APLP1P51693 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
APLP1P51693 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
APLP1P51693 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
APLP1P51693 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
APLP1P51693 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
APLP1P51693 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
APLP1P51693 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
APLP1P51693 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
APLP1P51693 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
APLP1P51693 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
APLP1P51693 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
APLP1P51693 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
APLP1P51693 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
APLP1P51693 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
APLP1P51693 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
APLP1P51693 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
APLP1P51693 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
APLP1P51693 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
APLP1P51693 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
APLP1P51693 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
APLP1P51693 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
APLP1P51693 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
APLP1P51693 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
APLP1P51693 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
APLP1P51693 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
APLP1P51693 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
APLP1P51693 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
APLP1P51693 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
APLP1P51693 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
APLP1P51693 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
APLP1P51693 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
APLP1P51693 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
APLP1P51693 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
APLP1P51693 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
APLP1P51693 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
APLP1P51693 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
APLP1P51693 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
APLP1P51693 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
APLP1P51693 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
APLP1P51693 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
APLP1P51693 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
APLP1P51693 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
APLP1P51693 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
APLP1P51693 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
APLP1P51693 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
APLP1P51693 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
APLP1P51693 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
APLP1P51693 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP1P51693 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
APLP1P51693 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP1P51693 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
APLP1P51693 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APLP1P51693 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP1P51693 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
APLP1P51693 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
APLP1P51693 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
APLP1P51693 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
APLP1P51693 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
APLP1P51693 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
APLP1P51693 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
APLP1P51693 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
APLP1P51693 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
APLP1P51693 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
APLP1P51693 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
APLP1P51693 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
APLP1P51693 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms