Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GJA8P48165 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GJA8P48165 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GJA8P48165 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GJA8P48165 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
GJA8P48165 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GJA8P48165 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GJA8P48165 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GJA8P48165 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GJA8P48165 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GJA8P48165 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GJA8P48165 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GJA8P48165 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GJA8P48165 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GJA8P48165 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
GJA8P48165 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GJA8P48165 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GJA8P48165 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GJA8P48165 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GJA8P48165 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GJA8P48165 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA8P48165 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA8P48165 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA8P48165 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GJA8P48165 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GJA8P48165 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GJA8P48165 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GJA8P48165 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GJA8P48165 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GJA8P48165 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GJA8P48165 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GJA8P48165 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GJA8P48165 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GJA8P48165 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GJA8P48165 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
GJA8P48165 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GJA8P48165 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
GJA8P48165 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GJA8P48165 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJA8P48165 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJA8P48165 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GJA8P48165 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJA8P48165 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJA8P48165 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJA8P48165 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJA8P48165 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GJA8P48165 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GJA8P48165 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GJA8P48165 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
GJA8P48165 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GJA8P48165 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GJA8P48165 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GJA8P48165 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GJA8P48165 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GJA8P48165 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GJA8P48165 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GJA8P48165 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GJA8P48165 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GJA8P48165 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GJA8P48165 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GJA8P48165 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GJA8P48165 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJA8P48165 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJA8P48165 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GJA8P48165 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJA8P48165 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJA8P48165 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJA8P48165 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJA8P48165 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJA8P48165 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJA8P48165 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GJA8P48165 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJA8P48165 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJA8P48165 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJA8P48165 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GJA8P48165 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GJA8P48165 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJA8P48165 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJA8P48165 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJA8P48165 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GJA8P48165 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJA8P48165 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJA8P48165 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJA8P48165 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJA8P48165 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GJA8P48165 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GJA8P48165 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GJA8P48165 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GJA8P48165 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GJA8P48165 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GJA8P48165 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJA8P48165 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJA8P48165 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJA8P48165 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJA8P48165 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GJA8P48165 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJA8P48165 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJA8P48165 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJA8P48165 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJA8P48165 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms