Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CTNNB1P35222 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CTNNB1P35222 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTNNB1P35222 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CTNNB1P35222 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTNNB1P35222 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CTNNB1P35222 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CTNNB1P35222 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CTNNB1P35222 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTNNB1P35222 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CTNNB1P35222 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTNNB1P35222 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTNNB1P35222 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CTNNB1P35222 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTNNB1P35222 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CTNNB1P35222 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CTNNB1P35222 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CTNNB1P35222 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CTNNB1P35222 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CTNNB1P35222 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTNNB1P35222 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTNNB1P35222 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTNNB1P35222 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTNNB1P35222 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTNNB1P35222 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTNNB1P35222 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTNNB1P35222 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CTNNB1P35222 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CTNNB1P35222 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTNNB1P35222 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CTNNB1P35222 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CTNNB1P35222 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CTNNB1P35222 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CTNNB1P35222 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTNNB1P35222 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CTNNB1P35222 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CTNNB1P35222 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CTNNB1P35222 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CTNNB1P35222 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CTNNB1P35222 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CTNNB1P35222 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTNNB1P35222 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CTNNB1P35222 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CTNNB1P35222 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CTNNB1P35222 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CTNNB1P35222 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CTNNB1P35222 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CTNNB1P35222 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CTNNB1P35222 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CTNNB1P35222 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CTNNB1P35222 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CTNNB1P35222 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CTNNB1P35222 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CTNNB1P35222 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CTNNB1P35222 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CTNNB1P35222 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CTNNB1P35222 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTNNB1P35222 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTNNB1P35222 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CTNNB1P35222 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CTNNB1P35222 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CTNNB1P35222 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTNNB1P35222 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTNNB1P35222 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CTNNB1P35222 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CTNNB1P35222 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CTNNB1P35222 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CTNNB1P35222 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CTNNB1P35222 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CTNNB1P35222 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CTNNB1P35222 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CTNNB1P35222 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CTNNB1P35222 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CTNNB1P35222 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CTNNB1P35222 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CTNNB1P35222 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CTNNB1P35222 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CTNNB1P35222 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CTNNB1P35222 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms