Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CHRNA5P30532 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CHRNA5P30532 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CHRNA5P30532 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHRNA5P30532 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHRNA5P30532 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHRNA5P30532 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CHRNA5P30532 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHRNA5P30532 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CHRNA5P30532 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHRNA5P30532 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CHRNA5P30532 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CHRNA5P30532 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CHRNA5P30532 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CHRNA5P30532 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CHRNA5P30532 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHRNA5P30532 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHRNA5P30532 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CHRNA5P30532 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHRNA5P30532 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHRNA5P30532 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHRNA5P30532 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHRNA5P30532 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHRNA5P30532 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CHRNA5P30532 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CHRNA5P30532 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHRNA5P30532 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHRNA5P30532 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CHRNA5P30532 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
CHRNA5P30532 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
CHRNA5P30532 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CHRNA5P30532 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CHRNA5P30532 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHRNA5P30532 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CHRNA5P30532 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHRNA5P30532 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHRNA5P30532 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CHRNA5P30532 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CHRNA5P30532 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CHRNA5P30532 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHRNA5P30532 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CHRNA5P30532 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CHRNA5P30532 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CHRNA5P30532 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHRNA5P30532 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHRNA5P30532 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHRNA5P30532 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHRNA5P30532 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHRNA5P30532 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHRNA5P30532 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHRNA5P30532 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHRNA5P30532 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHRNA5P30532 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHRNA5P30532 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHRNA5P30532 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHRNA5P30532 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHRNA5P30532 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHRNA5P30532 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHRNA5P30532 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHRNA5P30532 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHRNA5P30532 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHRNA5P30532 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHRNA5P30532 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHRNA5P30532 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHRNA5P30532 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CHRNA5P30532 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHRNA5P30532 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHRNA5P30532 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHRNA5P30532 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHRNA5P30532 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHRNA5P30532 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CHRNA5P30532 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHRNA5P30532 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHRNA5P30532 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CHRNA5P30532 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHRNA5P30532 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHRNA5P30532 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHRNA5P30532 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHRNA5P30532 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHRNA5P30532 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHRNA5P30532 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHRNA5P30532 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHRNA5P30532 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHRNA5P30532 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHRNA5P30532 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHRNA5P30532 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHRNA5P30532 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHRNA5P30532 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CHRNA5P30532 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHRNA5P30532 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHRNA5P30532 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHRNA5P30532 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHRNA5P30532 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHRNA5P30532 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHRNA5P30532 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms