Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APCP25054 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
APCP25054 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APCP25054 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APCP25054 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APCP25054 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APCP25054 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APCP25054 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APCP25054 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APCP25054 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APCP25054 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APCP25054 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APCP25054 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APCP25054 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APCP25054 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APCP25054 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APCP25054 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APCP25054 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
APCP25054 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
APCP25054 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APCP25054 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APCP25054 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APCP25054 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APCP25054 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APCP25054 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APCP25054 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APCP25054 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APCP25054 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APCP25054 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APCP25054 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APCP25054 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APCP25054 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APCP25054 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APCP25054 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APCP25054 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APCP25054 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APCP25054 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APCP25054 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APCP25054 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APCP25054 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APCP25054 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APCP25054 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APCP25054 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APCP25054 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APCP25054 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APCP25054 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APCP25054 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APCP25054 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APCP25054 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APCP25054 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APCP25054 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APCP25054 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APCP25054 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APCP25054 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APCP25054 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APCP25054 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APCP25054 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APCP25054 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APCP25054 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APCP25054 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APCP25054 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APCP25054 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APCP25054 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APCP25054 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APCP25054 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APCP25054 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APCP25054 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APCP25054 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APCP25054 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APCP25054 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APCP25054 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APCP25054 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APCP25054 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APCP25054 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APCP25054 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APCP25054 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APCP25054 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APCP25054 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APCP25054 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APCP25054 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APCP25054 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APCP25054 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APCP25054 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APCP25054 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APCP25054 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APCP25054 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APCP25054 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APCP25054 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APCP25054 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APCP25054 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APCP25054 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APCP25054 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APCP25054 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APCP25054 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APCP25054 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APCP25054 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APCP25054 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APCP25054 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APCP25054 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APCP25054 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms