Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRBP23467 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPRBP23467 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRBP23467 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRBP23467 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRBP23467 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRBP23467 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRBP23467 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRBP23467 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRBP23467 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRBP23467 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRBP23467 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRBP23467 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRBP23467 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRBP23467 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRBP23467 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRBP23467 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRBP23467 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRBP23467 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRBP23467 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRBP23467 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRBP23467 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRBP23467 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRBP23467 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRBP23467 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRBP23467 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRBP23467 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRBP23467 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRBP23467 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRBP23467 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRBP23467 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRBP23467 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRBP23467 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRBP23467 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRBP23467 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRBP23467 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRBP23467 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRBP23467 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRBP23467 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRBP23467 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRBP23467 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRBP23467 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRBP23467 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRBP23467 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRBP23467 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRBP23467 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRBP23467 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRBP23467 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRBP23467 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRBP23467 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRBP23467 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRBP23467 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRBP23467 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRBP23467 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRBP23467 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRBP23467 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRBP23467 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRBP23467 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRBP23467 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRBP23467 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRBP23467 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRBP23467 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRBP23467 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRBP23467 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRBP23467 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRBP23467 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRBP23467 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRBP23467 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRBP23467 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRBP23467 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRBP23467 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRBP23467 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRBP23467 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRBP23467 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRBP23467 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRBP23467 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRBP23467 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRBP23467 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRBP23467 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRBP23467 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRBP23467 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRBP23467 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRBP23467 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRBP23467 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRBP23467 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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