Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ATF3P18847 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.63■■■■■ 5.38
ATF3P18847 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.14■■■■■ 5.3
ATF3P18847 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ATF3P18847 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ATF3P18847 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.63■■■■■ 5.06
ATF3P18847 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
ATF3P18847 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ATF3P18847 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
ATF3P18847 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
ATF3P18847 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
ATF3P18847 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ATF3P18847 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.02■■■■■ 4.96
ATF3P18847 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
ATF3P18847 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
ATF3P18847 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ATF3P18847 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
ATF3P18847 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ATF3P18847 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ATF3P18847 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ATF3P18847 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATF3P18847 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATF3P18847 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ATF3P18847 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ATF3P18847 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ATF3P18847 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ATF3P18847 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ATF3P18847 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
ATF3P18847 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
ATF3P18847 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ATF3P18847 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ATF3P18847 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
ATF3P18847 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
ATF3P18847 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ATF3P18847 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44■■■■■ 4.63
ATF3P18847 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ATF3P18847 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ATF3P18847 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ATF3P18847 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ATF3P18847 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ATF3P18847 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
ATF3P18847 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ATF3P18847 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ATF3P18847 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ATF3P18847 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ATF3P18847 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ATF3P18847 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ATF3P18847 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ATF3P18847 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ATF3P18847 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ATF3P18847 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ATF3P18847 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ATF3P18847 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ATF3P18847 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ATF3P18847 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ATF3P18847 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ATF3P18847 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ATF3P18847 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ATF3P18847 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ATF3P18847 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ATF3P18847 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ATF3P18847 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ATF3P18847 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ATF3P18847 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ATF3P18847 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ATF3P18847 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
ATF3P18847 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ATF3P18847 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ATF3P18847 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ATF3P18847 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ATF3P18847 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ATF3P18847 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ATF3P18847 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
ATF3P18847 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ATF3P18847 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ATF3P18847 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ATF3P18847 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
ATF3P18847 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ATF3P18847 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ATF3P18847 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ATF3P18847 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ATF3P18847 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ATF3P18847 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ATF3P18847 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ATF3P18847 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ATF3P18847 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ATF3P18847 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ATF3P18847 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ATF3P18847 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
ATF3P18847 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ATF3P18847 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ATF3P18847 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ATF3P18847 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ATF3P18847 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ATF3P18847 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ATF3P18847 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ATF3P18847 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ATF3P18847 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ATF3P18847 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ATF3P18847 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms